生物学实验技术
植物总RNA的提取及RT-PCR
一、实验目的
1. 学习从植物组织中提取总RNA的方法
2. 了解RT-PCR的基本原理和实验方法
二、实验原理
1. RNA提取的原理
RNA是一类极易降解的分子,要得到完整的RNA,必须最大限度地抑制提取过程中内源性及外源性核糖核酸酶对RNA的降解。高浓度强变性剂异硫氰酸胍可溶解蛋白质,破坏细胞结构,使核蛋白与核酸分离,失活RNA酶,所以RNA从细胞中释放出来时不被降解。细胞裂解后,除了RNA,还有DNA、蛋白质和细胞碎片,通过酚、氯仿等有机溶剂处理得到纯化、均一的总RNA。
2. RT-PCR的原理
提取组织或细胞中的总RNA,以其中的mRNA作为模板,采用Oligo(dT)作引物利用逆转录酶反转录成cDNA。再以cDNA为模板进行PCR扩增,获得目的基因或检测基因表达。RT-PCR使RNA检测的灵敏性提高了几个数量级,使一些极为微量RNA样品分析成为可能。该技术主要用于分析基因的转录产物、获取目的基因和合成cDNA探针等。
三、仪器、药品与试剂配方
(一) 仪器及器皿
1. 低温离心机; 2.琼脂糖凝胶电泳系统; 3. 高压灭菌锅;
4. PCR仪; 5. 研钵; 6. 一次性手套等;
7. 离心管; 8. 培养皿; 9. 烧杯及试剂瓶等。
(二) 药品
1. 焦碳酸二乙酯(DEPC) 2. 异硫氰酸胍 (GT) 3. 醋酸钠(NaAc)
4. 苯酚 5. 异丙醇 6. 氯仿
7. 乙醇 8. β-巯基乙醇 9. 琼脂糖
10. MLV反转录试剂盒 11. Taq DNA聚合酶 12. 引物
(三) 试剂配制
1. 0.1% DEPC水 灭菌
2. 4 mol/L异硫氰酸胍
3. 2 mol/L NaAc (pH 4.8) 灭菌
4. 3 mol/L NaAc (pH 4.8) 灭菌
5. 4 mol/L LiCl 灭菌
6. 1×TE缓冲液:10 mM Tris-HCl(pH8.0),1 mM EDTA(pH8.0), 灭菌。
四、实验步骤
(一) 总RNA的提取
(1) 研钵冷却后,倒入2/3液氮,加入0.2 g植物材料,充分研磨后转入一个含有300
l的4M GT的1.5 ml的聚丙烯管中,摇匀。
(2) 加入30 l 2 M NaAc(pH4.9-5.2)摇匀,加入300 l酸酚(水饱和酚pH<5.0),
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