一种酶只作用于一类化合物或一定的化学键，以促进一定的化学变化，生成一定的产物。受酶催化的化合物称为该酶的底物或作用物
诱导契合：酶分子与底物的契合是动态的契合，当酶分子与底物分子接近时，酶蛋白受底物分子的诱导，其构象发生有利于同底物结合的变化，酶与底物在此基础上互补契合，进行反应
单纯酶：有些酶的活性仅仅决定于它的蛋白质结构，这些酶由简单蛋白质构成
结合酶：其结构中除含有蛋白质外，还含有非蛋白质部分，如大多数氧化还原酶类，这些酶由结合蛋白构成。在结合酶中蛋白质部分称为酶蛋白，非蛋白质部分称为辅因子。辅因子又分为辅酶和辅基两类，酶蛋白与辅因子结合成的完整分子称为全酶。
单体酶：单体酶只有一条多肽键，属于这类的酶很少，大多是催化水解反应的酶，它们的分子量较小，约为13000~35000，这类酶有核糖核酸酶，胰蛋白酶，溶菌酶
寡聚酶：这类酶由几条至几十条多肽链亚基组成，这些多肽链或相同，或不同。多肽链之间不是共价结合，彼此很容易分开，寡聚酶分子量从35000到几百万
多酶体系：由几种酶彼此嵌合形成的复合体。它有利于一系列反应的连续进行。这类多酶复合物得分子量很高，一般都在几百万以上。 酶的活性中心：酶的催化活力只集中表现在少数特异氨基酸残基的某一区域，这些特异性氨基酸残基比较集中并构成一定构象，此结构区域与酶活性直接相关称为酶的活性中心，所以酶的活性中心是酶和底物结合并发挥其催化作用的部位。一般处于酶分子的表面或裂隙中，酶的活性中心的化学基团是某些氨基酸残基的侧链或肽链的末端氨基或者羧基，主要依靠酶分子的二级和三级结构的形成才使这些在一级结构上互相远离的基团靠近，集中于分子表面的某一空间区域，故活性中心又称活性部位 活性中心的必需基团：酶的活性中心内的一些化学基团，是酶发挥催化作用与底物直接作用的有效集团
活性中心外的基团：不与底物直接作用，却与维持整个分子的空间构象有关，这些基团可使活性中心的各个有关基团保持合适的空间位置，间接的对酶的催化作用发挥其必不可少的作用
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