150) 我提取了一些水溶性多糖,但含大量的色素。我想用分子筛或离子交换将色素与多
糖分开,不知可行吗?色素会不会粘在填料上将填料污染?
只能说试试,色素种类很多,多糖也是如此,我也没有做过,只能试试.
你试试MCI GEL吧,这个东西分色素非常出色。 你找这个公司要资料吧。
010-51528296
sales@herbs-extract.com 151) 我想纯化一蛋白,分子量10kd左右,目的蛋白来自血液中,浓度大概为每毫升20
纳克左右,其他性质不详。手边暂时没有bio-rad蛋白质纯化用mini-protein电泳仪,无法用tricine-sds-page纯化。反相液相色谱柱c18又太贵,有没有其他比较好而且又经济的方案?谢谢。
只能在离子交换, 凝胶过滤, 疏水中去试吧.这么低的含量,先建立好的检测方法最要紧. 152) 你好, 我没做过层析,我想纯化经胃蛋白酶消化的血浆蛋白, 使产物F(ab')2含量达
到80%以上. 现在的工艺F(ab')2含量在45-65% . 请教大规模层析方案. 一次处理量为100万毫升, 蛋白含量约2% .
我觉得可以在疏水和离子交换的办法中去试.你的样品中主要的杂质是白蛋白和IgG吧,你也可以把这些物质去掉达到去除杂质提高纯度的目的.
153) 我想问一下C8柱用于分离蛋白质或肽类物质时,怎样选择洗脱的试剂?我对HP
LC不懂,但现在需要用!谢谢!
你查一篇文献就知道了,比较简单,就是低浓度的乙腈水加三氟乙酸平衡柱子,然后在用高浓度的乙腈水加三氟乙酸线性剃度洗脱,基本就这样,具体的浓度要自己看你蛋白特性而调整了.不少HPLC的文献都有具体的方法.
154) 今天花了一个晚上浏览,收获蛮大,我的问题是这样:纯化GST融合蛋白(加上
GST共90kD多),用amersham的1ml柱,曾经纯化出来,但酶切后就不见目的蛋白,只见GST,这次更悬,没有加凝血酶切,但洗脱柱后就在GST大小附近有带,菌液预先小量诱导有目的条带(90kD,没有GST条带),不知道是什么原因,诱导条件:IPTG0.1mM,26~29度3小时。细菌离心后用PBS重悬,-80度反复冻融3次,蛋白酶抑制剂只加了PMSF,超声(可能有点过,有部分泡沫),加tritonX100后RT摇20min,添加DTT至10mM(操作手册说可以增加跟柱的结合)后10000g离心,上清过柱按说明操作。SDS-PAGE的结果,沉淀仍然有大量目的条带,过柱前的上清的同一位置就只有很淡条带,过柱后相类似,PBS洗出液里蛋白就较稀少,但关键洗脱液中就只见约26kD的条带,怀疑GST,但从何而来?
我曾经按此步骤纯化过分子量比较小的一个蛋白(含GST约55kD),纯化得率还可以,但这次失败的原因是什么呢?
我怀疑是超声过了也许断裂了,所以这样,或者使蛋白变性都有可能,至于切了没有目标蛋白会不会切了以后不稳定,就沉淀在柱子上,这样就只有切的了,你可以用变性剂看看能不能洗下来东西.我想这是原因吧.
谢谢chromatography的教导,现在我已经决定不切除GST,凝血酶也很贵,不成功,则成#%¥,所以,应该GST对研究影响不大吧。
是不是融合蛋白在融合位点就特别脆弱呢?我添加的DTT是不是也有影响?怎样超声不会太过?我500ml菌液浓缩到15mlPBS,超声几次都还很粘稠,请再给予指点。 变性剂是指哪些?
此外,听您讲有国产的层析柱还是怎样,可否给小弟一些资料?
我不做上游,但是处理的时候,书上是写如果超声的强度过大,时间过长,有可能会变性或者断裂,加DTT有没有影响我不很清楚,预处理这个问题你还是问问外面做表达和提取的人吧.变性剂常用的是尿素和盐酸胍
155) 我的酶蛋白单体分子量约为90KD,其四聚体的分子量约为360。
我现在用的凝胶柱是S-200,是不是不大合适?此外,做SDS-PAGE时,有一条杂蛋白,和我的目标蛋白距离很近,一直分不开。不知道该怎么办?
你纯化出来应该是不错的,因为这样你的目标蛋白正好在纯化范围外,至于很近的杂质有没有可能是降解的产物呢,其实你也可以用s-100试试.如果没有,那就用现在的吧
156) 我在做一个核内定位的蛋白,预测等电点是10,60KD。做过好久的亲和纯化,有
N端his-tag,C端his-tag, 还有N端GST-tag的,纯化时的问题都一样:包涵体表达为主,上清含量很少。用低离子强度的PBS破菌的化,上清中含量会多一些,但是蛋白不挂亲和柱。洗脱出来的微量目的蛋白中目标蛋白只占很少一部分,用透析,PEG浓缩等等操作又都能使蛋白完全沉淀。上清用硫酸铵沉淀浓缩以后过疏水柱也不挂,也试过阴、阳离子柱,还是不挂柱。因为蛋白活性未知,所以我不倾向于做包涵体纯化,但是也曾经试过分级洗涤提包涵体蛋白,都没能拿到比较纯的包涵体,而且在包涵体中his-tag耦连的该蛋白也不挂柱,很迷惑,在变性条件下不应该存在tag被蛋白屏蔽的问题吧?
既然是包涵体本身应该有一定的纯度,不挂柱,那你用的是哪家的产品呢,此外怎么操作呢,你能说详细点吗,有的时候也许结合力比较弱,所以要选择镍密度高的填料,延长作用时间,提高pH值,降低流速,一般天然结构不挂的时候有,但是变性不挂很难理解,此外你的样品里有没有别的物质干扰挂柱,原因挺多的,所以需要你说详细点。
我用的亲和柱是qiageon的Ni-NTA agrose,应该不是镍柱质量问题,用这套操作体系纯化过几个其他his-蛋白效果都很理想,至于是不是有其他物质干扰我也不能确定,但是我试过这么多载体和tag,效果都一样,就觉得是蛋白本身性质的问题了
据说在靠近等电点附近的ph条件下,8M尿素体系的his蛋白是不挂柱的,不知是不是有这个情况,但是据预测的数据来看,好像ph8.0的缓冲体系应该不存在这个问题的
至于操作呢,亲和纯化我们用的都是agrose,在离心管里agrose与菌体上清4 度或者室温结合2hr~过夜不等,结合条件应该是很充分的了,很迷惑
另外如果是86KD的蛋白与其他60KD以下的杂带分开的话,用哪种型号的分子筛来做HPLC合适呢?
做HPLC的话那你可以用TSK系列的凝胶柱,不过处理不了多少样品,虽然每家都产镍柱,他们的产品其实结构是不一样的,而效果也会有一些差别,因此我建议你可以换一种填料试试,没有听说哪家的填料是最好的,我没有用过这个公司的填料,但是它的结构我很清楚,我个人感觉这个填料的吸附力是比较弱的,因为我看过一般洗脱通常在200-300uM咪唑之间,而且由于它的填料结构是有三个螯合基团螯合镍离子,而通常用的只有两个,这样剩余用在和his作用的镍离子的价数就少一个,这样必然会吸附力不如只有两个的,这是我个人的见解.我用的填料有不少洗脱要在300-400mM咪唑,可见作用力还是有差别的,结构也是有差别的,这些差别和琼脂糖没有关系,只和配基本身的结构有关.
如果你说的pH的问题,那你可以再提高pH看看,反正是变性的,无所谓,你提高的10或者10.5看看,也许这样能挂住.
此外你也可以考虑换个别的离子看看能不能挂柱,不过好象你的填料也没有办法换离子,这个也是它的缺陷.
157) 我用离子层析得到人总IgG,含有IgG1,IgG2,IgG3,IgG4,然后用亲和层析获得各
个亚类,它们的分子量分别为:146,146,170,146,分子量差别很小,用常规的SDS-PAGE+考马斯亮兰很难鉴定它们的纯度,请问用何方法来鉴定它们的各自纯度。
哦,什么亲和能把这几个亚类分开,我记得好象说只有羟基磷灰石能把一些亚类分开,至于鉴别我没有做过,我觉得只能用专门检测亚型的试剂盒去检测他们了.
158) 请问:DEAE-和CM-纤维素柱用完后可以用20%的酒精过柱保存吗?或用1M醋酸
钠 pH3.0?
还有它们的上样浓度一般在什么范围内?有没有什么要求?
应该可以用20%乙醇保存,就是柱子中填料也许会缩小一些,用醋酸钠也需要加防腐剂例如叠氮钠等把,否则也会长菌的.
上样的浓度应该关系不大,只和上样的总蛋白量有关,你可以查他们的载量,我觉得一般的离子交换填料的上样量也就在>20mg/ml左右,太高我没有上过. 159) 我现在想用蛋白来亲和纯化我的抗体 蛋白SDS-PAGE就有一条带,但western效果很差 所以我想进一步纯化一下蛋白,来亲和纯化抗体 现在我想电洗脱来纯化一下蛋白
但对用考染后的蛋白是不是可以用于亲和柱来纯化抗体呢
具体应注意什么问题呢
变性的蛋白既然能免疫,那么直接偶联到填料上做成柱子来纯化你的抗体应该没有问题,但是变性后的蛋白偶联很麻烦,因为如果你的变性蛋白要在盐酸胍或者脲里溶液,那它们都有氨基也许也会和活化的填料偶联,所以你的蛋白在普通缓冲液中能溶解才成.考染后的蛋白估计是不适合做抗体的配基,你可以跑电泳只切一条染色,这样知道位置后再把剩下电泳板切胶电洗脱就可以.我没有做过这个实验,所以抱歉,你可以在DXY里搜索,你会找到电洗脱的一些帖子的.
160) 请问chromatography : 我用QIAGEN公司的Ni-NTA纯化his tag 融合蛋白,杂带
忒多,摸过很多条件,做过很多不同的蛋白,结果都一样.能否麻烦老兄寄一份his纯化的资料让我好好学习学习.
我已经把材料发给你了,你可以参考一下,或者改用我们公司的镍琼脂糖凝胶试试.去除这些杂带一般可以用降低pH洗脱,同时在缓冲液里加一些非离子表面活性剂,这样可以降低非特异吸附.
161) 你好版主!我想请教一个问题:8M尿素溶解的蛋白能否直接做疏水或凝胶层析?
另外separose 4FF分离2万左右分子量的蛋白效果会如何?如果改成 6FF应该怎样换介质?
8M尿素溶解的蛋白不加盐的话估计是挂不住的,你可以降低一点脲的浓度,这样才能保证硫酸铵能溶解在这里面.做凝胶过滤得小心点,在变性的条件下,蛋白都是线性分子,凝胶过滤是很难分开的.用separose系列分离这么小的效果也不会好的,除非是差别很大,即使separose6FF也未必好用.
162) 请问chromatography 师兄, 纯化his蛋白,用降低pH洗脱和梯度咪唑洗脱有什么
不同吗? 梯度ph洗难道不会使蛋白变性吗?
低pH和咪唑不一样,降低pH可以减弱蛋白和金属离子的作用离,这样吸附弱的蛋白容易被洗脱,而咪唑是竞争洗脱,它们原理是不同的,互相配合可以使一些咪唑洗不去的杂带洗掉,低pH也就到4-5左右,短时间不少蛋白不会变性的.
163) 偶纯化一个原核表达的热休克蛋白融合蛋白,超声裂菌后40%硫酸铵沉淀,然后
DEAE Sepharose FF纯化下来纯度85%左右,有3条杂带,分别为130KD+、~55KD、~45KD,目标蛋白分子量为74KD,偶的要求是要达到电泳纯所以偶选了phenyl做进一步纯化,可是偶的这个蛋白比较奇怪2M NaCl才能挂柱,(用硫酸铵的话还没挂柱就沉淀了),可是挂上之后0M NaCl也洗不下来,而且杂蛋白的性质和目标蛋白很象也弄不下来,是不是偶的疏水做的有问题呀?还有一个问题就是国产的柱子和仪器哪家的比较好?我现在用的柱子没有接头,对拉梯度会不会有很大影响?
其实你这个操作我觉得你可以这样,沉淀后直接上疏水,然后再过离子交换,至于你说的沉淀你可以稀释到低一些的硫酸铵蛋白就不沉淀了,它不需要那么高的浓度,一般1.5M左右看有没有沉淀,能不能挂在柱子上,洗脱洗不下来可以在洗脱液体中加5-10%的甘油或者乙二醇,
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