直翅目昆虫线粒体基因组比较、谱系及进化研究

直翅目昆虫线粒体基因组比较、谱系及进化研究

本研究利用直翅目昆虫线粒体

DNA特异性引物,采用传统方法直接测序获得

了小凸额蝗(Traulia minuta)、印度橄蝗(Tagasta indica)、僧帽佛蝗(Phlaeoba infumata)、秦岭蹦蝗(Sinopodisma tsinlingensis)

、素色异爪蝗

、

(Euchorthippus unicolor)、拟短翅拟埃蝗(Pseudoeosyllina brevipennisoide)黑角露螽(Phaneroptera nigroantennata)乎完整的8条线粒体基因组序列。基于序并组装注释获得了武陵山蹦蝗(Pedopodisma tsinlingensis)粒体基因组序列。

本研究测定的11条直翅目昆虫线粒体基因组序列

,加上实验室测定未发表

153条,

及拟叶螽(Orophyllus sp.)

完整或几

Hiseq2500测序平台,高通量测序技术测

、秦岭小蹦蝗

(Sinopodisma wulingshanensis)

及日本黄脊蝗(Patangajaponica)三个物种全线

线粒体基因组序列及NCBI上已提交的直翅目昆虫全线粒体基因组序列共应用比较基因组学,谱系基因组学及进化生物学等方法进行了分析下:1、本研究获得了 11条直翅目昆虫线粒体基因组序列70%以上,13个蛋白编码基因密码子第三位

,获得结论如

,AT含量普遍偏高,在

AT含量普遍高于密码子第一位和第二

位;11个物种线粒体基因组J链序列、22个tRNAs和AT富集区的碱基组成具有明显AT-skew和CG-skew;13个蛋白编码基因的密码子使用频率较高的是

UUA、

UCU、UCA和ACA;11个物种的tRNAs二级结构与其它直翅目昆虫的二级结构基本一致。2、秦岭蹦蝗、比氏蹦蝗、武陵山蹦蝗、霍山蹦蝗及秦岭小蹦蝗线粒体基因组比较分析表明:①蹦蝗属和小蹦蝗属线粒体基因组虫中最高。

②5种蝗虫最保守的tRNA是trnA,trnLCUN,trnF

和trnG,只有一个核苷酸变A+T含量在整个直翅目昆