(二)英文缩写符号
1.GOT(Glutamate-oxaloacetate transaminase):谷草转氨酶, 2.GPT(Glutamate-pyruvate transaminase):谷丙转氨酶 3.APS(Adenosine phosphosulfate):腺苷酰硫酸 4.PAL(Pheny-lalanine ammonia lyase):苯丙氨酸解氨酶 5.PRPP(Phosphoribosyl pyrophosate):5-磷酸核糖焦磷酸 6.SAM (S-adenoymethionine):S-腺苷蛋氨酸 7.GDH (Glutamate drhyddrogenase):谷氨酸脱氢酶 8.IMP(Inosinic acid):次黄嘌呤核苷酸
核酸的生物合成
(一)名词解释
1.半保留复制(semiconservative replication) 2.不对称转录(asymmetric trancription) 3.逆转录(reverse transcription) 4.冈崎片段(Okazaki fragment) 5.复制叉(replication fork) 6.领头链(leading strand) 7.随后链(lagging strand) 8.有意义链(sense strand) 9.光复活(photoreactivation)
10.重组修复(recombination repair) 11.内含子(intron) 12.外显子(exon)
13.基因载体(genonic vector) 14.质粒(plasmid)
(一)名词解释
1.半保留复制:双链DNA的复制方式,其中亲代链分离,每一子代DNA分子由一条亲代链和一条新合成的链组成。
2.不对称转录:转录通常只在DNA的任一条链上进行,这称为不对称转录。 3.逆转录:Temin和Baltimore各自发现在RNA肿瘤病毒中含有RNA指导的DNA聚合酶,才证明发生逆向转录,即以RNA为模板合成DNA。
4.冈崎片段:一组短的DNA片段,是在DNA复制的起始阶段产生的,随后又被连接酶连接形成较长的片段。在大肠杆菌生长期间,将细胞短时间地暴露在氚标记的胸腺嘧啶中,就可证明冈崎片段的存在。冈崎片段的发现为DNA复制的科恩伯格机理提供了依据。 5.复制叉:复制 DNA分子的 Y形区域。在此区域发生链的分离及新链的合成。
6.领头链:DNA的双股链是反向平行的,一条链是5/→3/方向,另一条是3/→5/方向,上述的起点处合成的领头链,沿着亲代DNA 单链的3/→5/方向(亦即新合成的DNA沿5/→3/方向)不断延长。所以领头链是连续的。
7.随后链:已知的DNA聚合酶不能催化DNA链朝3/→5/方向延长,在两条亲代链起点的3/ 端一侧的DNA链复制是不连续的,而分为多个片段,每段是朝5/→3/方向进行,所以随后链是不连续的。
8.有意义链:即华森链,华森——克里格型DNA中,在体内被转录的那股DNA链。简写为W strand。
9.光复活:将受紫外线照射而引起损伤的细菌用可见光照射,大部分损伤细胞可以恢复,这种可见光引起的修复过程就是光复活作用。
10.重组修复:这个过程是先进行复制,再进行修复,复制时,子代DNA链损伤的对应部
位出现缺口,这可通过分子重组从完整的母链上,将一段相应的多核苷酸片段移至子链的缺口处,然后再合成一段多核昔酸键来填补母链的缺口,这个过程称为重组修复。 11.内含子:真核生物的mRNA前体中,除了贮存遗传序列外,还存在非编码序列,称为
内含子。
12.外显子:真核生物的mRNA前体中,编码序列称为外显子。
13.基因载体:外源DNA片段(目的基因)要进入受体细胞,必须有一个适当的运载工具
将带入细胞内,并载着外源DNA一起进行复制与表达,这种运载工具称为载体。 14.质粒:是一种在细菌染色体以外的遗传单元,一般由环形双链DNA构成,其大小从1
—200Kb。
代谢调节
(一)名词解释
1.诱导酶(Inducible enzyme) 2.标兵酶(Pacemaker enzyme) 3.操纵子(Operon) 4.衰减子(Attenuator) 5.阻遏物(Repressor) 6.辅阻遏物(Corepressor)
7.降解物基因活化蛋白(Catabolic gene activator protein) 8.腺苷酸环化酶(Adenylate cyclase) 9.共价修饰(Covalent modification) 10.级联系统(Cascade system) 11.反馈抑制(Feedback inhibition) 12.交叉调节(Cross regulation)
13.前馈激活(Feedforward activation) 14.钙调蛋白(Calmodulin)
(二)英文缩写符号
1. CAP(Catabolic gene activator protein): 2. PKA(Protein kinase): 3. CaM(Calmkdulin): 4. ORF(Open reading frame):
(一)、名词解释:
1. 诱导酶:由于诱导物的存在,使原来关闭的基因开放,从而引起某些酶的合成数量明显增加,这样的酶称为诱导酶
2. 标兵酶:在多酶促系列反应中,受控制的部位通常是系列反应开头的酶,这个酶一般是变构酶,也称标兵酶。
3. 操纵子:在转录水平上控制基因表达的协调单位,包括启动子(P)、操纵基因(O)和在功能上相关的几个结构基因。
4. 衰减子:位于结构基因上游前导区调节基因表达的功能单位,前导区转录的前导RNA通过构象变化终止或减弱转录。
5. 阻遏物:由调节基因产生的一种变构蛋白,当它与操纵基因结合时,能够抑制转录的进行。
6. 辅阻遏物:能够与失活的阻碣蛋白结合,并恢复阻遏蛋白与操纵基因结合能力的物质。辅阻遏物一般是酶反应的产物。
7. 降解物基因活化蛋白:由调节基因产生的一种cAMP受体蛋白,当它与cAMP结合时被激活,并结合到启动子上促进转录进行。是一种正调节作用。
8. 腺苷酸环化酶:催化ATP焦磷酸裂解产生环腺苷酸(cAMP)的酶。
9. 共价修饰:某种小分子基团可以共价结合到被修饰酶的特定氨基酸残基上,引起酶分子构象变化,从而调节代谢的方向和速度。
10. 级联系统:在连锁代谢反应中一个酶被激活后,连续地发生其它酶被激活,导致原始调
节信号的逐级放大,这样的连锁代谢反应系统称为级联系统。
11. 反馈抑制:在代谢反应中,反应产物对反应过程中起作用的酶产生的抑制作用。 12. 交叉调节:代谢产物不仅对本身的反应过程有反馈抑制作用,而且可以控制另一代谢物
在不同途径中的合成。
13. 前馈激活:在反应序列中,前身物质对后面的酶起激活作用,使反应向前进行。
14. 钙调蛋白:一种依赖于钙的蛋白激酶,酶蛋白与钙结合引起酶分子构象变化,调解酶的
活性。如磷酸化酶激酶是一种依赖于钙的蛋白激酶。
(二)英文缩写符号
1. CAP(Catabolic gene activator protein):降解物基因活化蛋白 2. PKA(Protein kinase):蛋白激酶A 3. CaM(Calmkdulin):钙调蛋白 4. ORF(Open reading frame):开放阅读框架
蛋白质的生物合成
(一)名词解释
1.密码子(codon)
2.反义密码子(synonymous codon) 3.反密码子(anticodon)
4.变偶假说(wobble hypothesis) 5.移码突变(frameshift mutant) 6.氨基酸同功受体(isoacceptor) 7.反义RNA(antisense RNA) 8.信号肽(signal peptide) 9.简并密码(degenerate code) 10.核糖体(ribosome) 11.多核糖体(poly some)
12.氨酰基部位(aminoacyl site) 13.肽酰基部位(peptidy site)
14.肽基转移酶(peptidyl transferase)
15.氨酰- tRNA合成酶(amino acy-tRNA synthetase) 16.蛋白质折叠(protein folding) 17.核蛋白体循环(polyribosome) 18.锌指(zine finger)
19.亮氨酸拉链(leucine zipper)
20.顺式作用元件(cis-acting element) 21.反式作用因子(trans-acting factor) 22.螺旋-环-螺旋(helix-loop-helix)
(二)英文缩写符号
1.IF(initiation factor):
2.EF(elongation factor): 3.RF(release factor):
4.hnRNA(heterogeneous nuclear RNA): 5.fMet-tRNAf : 6.Met-tRNAi :
(一) 名词解释
1.密码子(codon):存在于信使RNA中的三个相邻的核苷酸顺序,是蛋白质合成中某一特定氨基酸的密码单位。密码子确定哪一种氨基酸叁入蛋白质多肽链的特定位置上;共有64个密码子,其中61个是氨基酸的密码,3个是作为终止密码子。 2.同义密码子(synonym codon):为同一种氨基酸编码的几个密码子之一,例如密码子UUU和UUC 二者都为苯丙氨酸编码。 3.反密码子(anticodon):在转移RNA反密码子环中的三个核苷酸的序列,在蛋白质合成中通过互补的碱基配对,这部分结合到信使RNA的特殊密码上。 4.变偶假说(Wobble hypothesis):克里克为解释tRNA分子如何去识别不止一个密码子而提出的一种假说。据此假说,反密码子的前两个碱基(3ˊ端)按照碱基配对的一般规律与密码子的前两个(5ˊ端)碱基配对,然而tRNA反密码子中的第三个碱基,在与密码子上3ˊ端的碱基形成氢键时,则可有某种程度的变动,使其有可能与几种不同的碱基配对。
5.移码突变(frame-shift mutation):一种突变,其结果为导致核酸的核苷酸顺序之间的正常关系发生改变。移码突变是由删去或插入一个核苷酸的点突变构成的,在这种情况下,突变点以前的密码子并不改变,并将决定正确的氨基酸顺序;但突变点以后的所有密码子都将改变。且将决定错误的氨基酸顺序。 6.氨基酸同功受体(isoacceptor):每一个氨基酸可以有多过一个tRNA作为运载工具,这些tRNA称为该氨基酸同功受体。 7.反义RNA(antisense RNA):具有互补序列的RNA。反义RNA可以通过互补序列与特定的mRNA相结合,结合位置包括mRNA 结合核糖体的序列(SD序列)和起始密码子AUG,从而抑制mRNA 的翻译。又称干扰mRNA 的互补RNA。
8.信号肽(signal peptide): 信号肽假说认为,编码分泌蛋白的mRNA在翻译时首先合成的是N 末端带有疏水氨基酸残基的信号肽,它被内质网膜上的受体识别并与之相结合。信号肽经由膜中蛋白质形成的孔道到达内质网内腔,随即被位于腔表面的信号肽酶水解,由于它的引导,新生的多肽就能够通过内质网膜进入腔内,最终被分泌到胞外。翻译结束后,核糖体亚基解聚、孔道消失,内质网膜又恢复原先的脂双层结构。 9. 简并密码(degenerate codon):或称同义密码子(synonym codon),为同一种氨基酸编
码几个密码子之一,例如密码子UUU和UUC二者都为苯丙氨酸编码。
10.核糖体(ribosome): 核糖体是很多亚细胞核蛋白颗粒中的一个,由大约等量的RNA 和蛋白质所组成,是细胞内蛋白质合成的场所。每个核糖核蛋白体在外形上近似圆形,直径约为20nm。由两个不相同的亚基组成,这两个亚基通过镁离子和其它非共价键地结合在一起。已证实有四类核糖核蛋白体(细菌、植物、动物和线粒体)它们以其单体的、亚单位的和核糖核蛋白体RNA的沉降系数相区别。细菌核蛋白体含有约50个不同的蛋白质分子和3个不同的RNA分子。小的亚单位含有约20个蛋白质分子和1个RNA分子。大的亚单位含有约30个蛋白质分子和2个RNA 分子。核蛋白体有两个结合转移RNA的部位(部位和部位),并且也能附上信使RNA,简写为Rb。
11.多核糖体(polysome):在信使核糖核酸链上附着两个或更多的核糖体。 12.氨酰基部位(aminoacyl site):在蛋白质合成过程中进入的氨酰-tRNA结合在核蛋白体
上的部位。
13.肽酰基部位(peptidy site):指在蛋白质合成过程中,当下一个氨酰基转移RNA接到核
糖核蛋白体的氨基部位时,肽酰tRNA所在核蛋白体上的结合点。 14.肽基转移酶(peptidyl transferase):蛋白质合成中的一种酶。它能催化正在增长的多肽
链与下一个氨基酸之间形成肽键。在细菌中此酶是50S核糖核蛋白体亚单位中的蛋白质之一。
15.氨酰-tRNA合成酶(amino acy-tRNA synthetase):催化氨基酸激活的偶联反应的酶,先
是一种氨基酸连接到AMP生成一种氨酰腺苷酸,然后连接到转移RNA分子生成氨酰-tRNA分子。
16.蛋白质折叠(protein folding):蛋白质的三维构象,称为蛋白质的折叠。是由蛋白质多
肽链的氨基酸顺序所决定的。不同的蛋白质有不同的氨基酸顺序,也就各自按照一定的方式折叠而成该蛋白质独有的天然构象。这个蛋白质折叠是在自然条件下自发进行的,在生物体内条件下,它是在热力学上最稳定的形式。多肽链在核糖体上一面延长,一面自发地折叠成其本身独有的构象。当肽链终止延长并从核糖体上脱落时,它也就折叠成天然的三维结构。
17.核蛋白体循环(polyribosome):是指已活化的氨基酸由tRNA转运到核蛋白体合成多肽
链的过程。
18.锌指(zine finger):是调控转录的蛋白质因子中与DNA结合的一种基元,它由大约30
个氨基酸残基的肽段与锌螯合形成的指形结构,锌以4个配位键与肽链的Cys或His残基结合,指形突起的肽段含12-13个氨基酸残基,指形突起嵌入DNA的大沟中,由指形突起或其附近的某些氨基酸侧链与DNA的碱基结合而实现蛋白质与DNA的结合。 19.亮氨酸拉链(leucine zipper):这是真核生物转录调控蛋白与蛋白质及与DNA结合的基
元之一。两个蛋白质分子近处C 端肽段各自形成两性α-螺旋,α-螺旋的肽段每隔7个氨基酸残基出现一个亮氨酸残基,两个α-螺旋 的疏水面互相靠拢,两排亮氨酸残基疏水侧链排列成拉链状形成疏水键使蛋白质结合成二聚体,α-螺旋的上游富含碱性氨基酸(Arg 、Lys)肽段借Arg 、Lys 侧链基团与DNA的碱基互相结合而实现蛋白质与DNA的特异结合。
20.顺式作用元件(cis-acting element):真核生物DNA的转录启动子和增强子等序列,合
称顺式作用元件。
21.反式作用因子(trans-acting factor):调控转录的各种蛋白质因子总称反式作用因子。 22.螺旋—环—螺旋(helix-loop-helix):这种蛋白质基元由两个两性α—螺旋通过一个肽段
连结形成螺旋—环—螺旋结构,两个蛋白质通过两性螺旋的疏水面互相结合,与DNA的结合则依靠此基元附近的碱性氨基酸侧链基团与DNA的碱基结合而实现。
(二) 英文缩写符号
1.IF(initiation factor):原核生物蛋白质合成的起始因子。
2.EF(elongation factor):原核生物蛋白质合成的延伸因子。 3.RF(release factor):原核生物蛋白质合成的终止因子(释放因子)。 4.hnRNA(heterogeneous nuclear RNA):核不均一RNA。
5.fMet-tRNAf :原核生物蛋白质合成的第一个氨酰基转移RNA。 6.Met-tRNAi :真核生物蛋白质合成的第一个氨酰基转移RNA。
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