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分子生物学笔记 - 图文

来源:用户分享 时间:2025/6/30 8:34:39 本文由loading 分享 下载这篇文档手机版
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蛋白与DNA的紧密结合能力。

组蛋白甲基化修饰:甲基化酶Ⅰ:存在胞质中,对组蛋白特异性,以SAM为供体,催化组蛋白中的Arg;甲基化酶Ⅱ:存在胞质中,没有特异性,负责酸性AA甲基化;甲基化酶Ⅲ:存在细胞核中,对组蛋白特异性,以SAM为供体,催化组蛋白中的Lys。组蛋白的甲基化可能是调节组蛋白的静电荷,改变组蛋白之间、组蛋白与DNA之间的静电作用,从而改变染色质结构。组蛋白甲基化是活化还是抑制基因表达取决于甲基化的位点。

组蛋白磷酸化修饰:会增加组蛋白与DNA之间的静电斥力,导致染色质结构松散,基因的表达增强。

DNA甲基化修饰:DNA甲基化会抑制转录,使基因沉默。通常发生在一条链的CpG位点,当两条链上的CpG位点都被甲基化,则称完全甲基化位点;当只有一条链甲基化,称为半甲基化。DNA甲基转移酶:维持甲基化酶可使半甲基化成为完全甲基化;重新甲基化酶使非甲基化成为半甲基化。细胞中DNA甲基化3种状态:持续低甲基化(持家基因);诱导的去甲基化(表达中的奢侈基因);高甲基化(如巴氏小体)。甲基化的CpG序列可招募组蛋白去乙酰化酶,使组蛋白去乙酰化达到抑制基因表达。

50、表观遗传学:研究在DNA序列未发生变化的前体下,可遗传的基因表达改变的现象。组蛋白翻译后的修饰和DNA的修饰及其如何调控基因表达是表观遗传学研究的内容。 51、真核mRNA同时具有5’帽子3’尾巴则翻译效率协同增加;5’-UTR长度17~80nt时,翻译效率与长度成正比,过短过长影响效率;5’-UTR高级结构和较高的GC含量对翻译的起始有妨碍。

52、原核mRNA的SD序列与起始密码之间最佳距离是9nt。

53、在3’-UTR区与polyA尾紧靠的前端是富含AU的重复序列(ARE,不是加尾信号序列),它对翻译起重要调控作用。首先,polyA尾能促进mRNA穿越核膜,还影响mRNA稳定性和翻译效率;polyA尾长度对翻译也有影响,每翻译一次,尾巴就缩短一些。polyA结合蛋白(PABP)结合polyA尾的最短长度是12nt。PABP的结合可以保护polyA尾被降解,但是每次翻译,PABP必须离开,所以polyA尾还是要被缩短一些,直到小于12nt,PABP无法结合上去后就加速降解了。另外ARE控制mRNA的去腺嘌呤,决定mRNA半衰期。 54、同源异型框:简称同源框,是同源异型基因中一段高度保守的DNA序列

55、同源异型基因:一类含有同源框的基因。该类基因的突变,就会在胚胎发育过程中导致某一器官异位生长,即本来应该形成的正常结构被其他器官取代了。例如,果蝇的同源异型基因Antp(触角基因)的突变,导致果蝇的一对触角被两只腿所取代。

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56、比较原核生物和真核生物基因表达调控的异同点。P277 Chapter 7 基因突变与遗传重组的分子机制

突变体 (mutant):指与野生型或正常型不同的基因或个体。

突变(mutation):指DNA分子上发生的可遗传的变化。 诱变:产生突变的过程。 突变剂(mutagen):指能引起突变(或增加突变频率)的物理或化学因素。 转换:核苷酸替换中,嘌呤被替换为嘌呤,嘧啶被替换为嘧啶的点突变。 颠换:核苷酸替换中,嘌呤被替换为嘧啶,嘧啶被替换为嘌呤的点突变。

沉默突变:又称同义突变,虽然密码子改变了,但由于密码子的简并,并未使编码的AA发生变化。

错义突变:DNA的突变引起mRNA中密码子改变,编码另一种氨基酸。有时尽管AA变了,但是与原AA性质相近,并未引起蛋白质功能的太大变化,这时称为中性突变。 无义突变:DNA的突变导致原AA密码子改变为一种终止密码。

移框突变:由于在DNA中插入或缺失不等于3的倍数的核苷酸,引起mRNA读码框架改变。

1、 Ⅰ单碱基变化: A.脱氨基作用 B.烷基化 C.氧化 A. UV线引起TT或CT二聚体

DNA突变的类型: Ⅱ结构的改变: B.嵌入诱变剂:如AO、EB,能插入DNA中引起

脱氧核苷酸缺失或增加。

C.碱基类似物:引起复制过程中碱基错配。

Ⅲ DNA骨架链的断裂:A.碱基与核糖之间的糖苷键断裂;B.双链的断裂

2、DNA 复制过程中错配修复的机制

答:DNA聚合酶具有从3’向5’的外切酶活性,将DNA复制过程中错误概率控制在10-8水平,而复制过程中的错配修复(MRS)将该概率进一步控制在10-11。MRS系统包括DNA聚合酶、连接酶、m6A甲基化酶、由H,L,S 3个亚基组成的错配校正酶MCE等重要酶类的共同作用。步骤:①错配校正酶H亚基聚集于复制叉附近按GATC序列中m6A逐渐减少的梯度信息,随时监控识别新生链中非m6A的CTAG序列;②L亚基扫描新生链中错配碱基;③一旦发现错配碱基,S亚基就对新生DNA链中发生了错配的区段进行酶切。④被切除的单链DNA中的空缺由DNA聚合酶和连接酶进行重新合成和连接,完成错配的修复。 3、U嘧啶掺入DNA 后的修复

答:U作为T的类似物容易替代T掺入DNA中,或者C发生转换突变为U(氧化脱氨),

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生物体中具有尿嘧啶-N-糖苷酶系统(ung系统)进行修复。①尿嘧啶-N-糖苷酶能够准确识别新生DNA链中的U,将U切除,形成无碱基的核苷酸;②再由无嘌呤内切酶切除邻近核苷酸形成缺口;③由DNA聚合酶和连接酶重新合成与连接,填补缺口,完成修复。 4、紫外线引起的DNA损伤的四种修复机制:光修复,核苷酸切除修复(切补修复),重组修复(错误倾向的修复),SOS抢救修复

4-1、光修复:也称直接修复。在400nm可见蓝光的诱导下,编码471个氨基酸的光修复酶基因被激活表达,光修复酶与TT二聚体结合后,随即切除二聚体间的共价键,使DNA得损伤部位在复制前就直接得以修复,这是“避免差错”的复制前修复。

4-2、切补修复:切补修复以UvrA、UvrB、UvrC基因为主体。①由蛋白复合体识别嘧啶二聚体;②由解旋酶将嘧啶二聚体处的双螺旋解开;③UvrA、UvrB、UvrC基因产物具有外切酶和内切酶活性,切除单链DNA中的损伤部位;④DNA聚合酶以正常互补链为模板重新合成并由连接酶完成连接。这也是“避免差错”的复制前修复。

4-3、重组修复:以存在TT二聚体的链为模板合成的新链中间与TT相对应的区域是空缺的,即新链是断裂的。重组修复就是在重组基因ReaA酶的作用下,以另外一对正常的DNA链中的一条为模板,将空缺的对应区域通过交换重组的方式置换到空缺区域,则新链的不足被弥补了,而这条模板成了空缺链,再以它原先的配对链为模板,重新合成填补新空缺。即“拆东墙,补西墙”。该机制没有对二聚体进行修复,只是二聚体链被不断“稀释”,并且避免出现断链,维持了生物体的存活,故这是“倾向差错”的修复机制。

4-4、SOS修复:LexA基因的编码产物是一种阻遏蛋白,不仅对自身基因进行负控制,且对RecA、UmuC等11个能引起突变的基因也有抑制效应。DNA分子经UV照射后产生大于5nt的游离单链DNA片段,它作为信号分子不仅使RecA蛋白激活出能降解LexA阻遏蛋白的蛋白酶活性,消除了它的负控制抑制效应,还促使RecA高于正常条件300倍以上的效率进行转录,使重组修复机制启动,DNA损伤得到倾向差错的修复。同时UmuC等11个基因的抑制也解除,提高了发生突变的概率。当DNA损伤被修复后,RecA高效表达停止,LexA的负控制重新启动,SOS修复系统关闭。这是消耗大量能量的“竭尽全力,救死扶伤”的修复机制。

5、不同途径修复的共同特点:多个蛋白相互作用,批次间按次序在DNA上进行装备完成各自的功能,最终完成DNA的修复。

修复的共同步骤: chromatin loosening, sensing DNA damage by repair machinery→ removal of damage by repair machinery →gap filled in by DNA polymerase →chromatin remodel

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