Find Symmetry….：打开Find Symmetry对话框，可以寻找当前晶体或非周期结构的对称性并应用它。
Unbuild Crystal/Surface：取消当前建立的晶体或表面。
Nonperiodic Superstructure：从无限晶体或表面中产生一个有限部分。
Make P1/Make p1:从当前晶体或表面中去掉除平移周期性以外的其它对称性。 SuperCell：打开SuperCell 对话框，从当前晶体或表面建立一个超晶胞。
Redefine Lattice：打开Redifine Lattice对话框，根据当前已经存在的晶体或表面，重新定义新的晶格矢量。
Primitive Cell/Rhombohedral Representation：把当前不是以原胞结构显示的晶体或表面结构转换为原胞结构。
Conventional Cell/Hexagonal Representation：把当前不是以晶胞显示的晶体或表面以晶胞显示。
Tools菜单
Tools菜单包括操作当前窗口中对象的命令，如查找等同原子、预览反应和振动分析。它也包括打开服务器控制窗口和选项对话框。
注意：此菜单内容随着活动文档类型的不同而不同。
标准Tools菜单
所有Tools菜单都包括以下菜单项：
Server Console：打开服务器控制窗口，查看运行在服务器上的任务。 Options….：打开选项对话框，包含以下选项卡：
? General选项卡用来改变Materials Studio环境默认设置。
? Folder Locations选项卡用来改变Materials Studio使用的目录位置。 ? Graphics选项卡用来改变Materials Studio默认绘图设置。
三维模型文档Tools菜单
另外，当三维模型文档为当前活动文档时，Tools菜单还包括：
Find Equivalent Atoms：打开Find Equivalent Atoms对话框，在当前文档中查找与出现在另一文档中出现的等同的原子。原子匹配对于使用Reaction Preview对话框浏览反应路径是必须的。
Reaction Preview：打开Reaction Preview对话框，可以在反应物和化学反应生产物之间使用内插法确定反应路径。
Vibrational Analysis：打开Vibrational Analysis对话框，可以在合适的三维模型文档中计算分子的振动模式。
Modules菜单
Modules菜单提供使用你安装了的Materials Studio模块的方法。 注意：此菜单随着已经安装了的模块的不同而不同。
模块菜单
模块菜单包括一些或全部下述菜单项：
Amorphous Cell：提供Amorphous Cell模块中的工具，可以建立复杂无定型系统中的代表性模型并预测它们的性质。
CASTEP：提供CASTEP模块中的工具，可以进行第一原理量子力学计算，研究如半导体、陶瓷、金属、矿物和浮石等晶体或表面的性质。
Dmol3:提供Dmol3模块中的工具，可以进行基于泛函密度理论的量子力学计算，分析分子和周期系统。
PDP：提供PDP模块中的工具，可以进行大尺度长时间的介观动力学模拟。
Discover：提供Discover经典模拟模块中的工具，可以优化分子结构，计算电子经典轨道，分析很大范围内的结构和轨道的性质。
Equilibria：提供Equilibria模块中的工具，可以确定烷烃和其它小分子结构的相图。 Forcite：提供Forcite模块中的分子动力学工具，可以研究很大范围内的系统。它最主要的近似是原子核运动所处的势场用经典力场代替。
MesoDyn：提供MesoDyn模块中的工具，可以研究复杂流体动力学和在大尺度长时间中的平衡状态。
Reflex：提供Reflex和Relex Plus模块中的工具，可以查看、模拟、索引和精修粉末衍射的数据，求解晶体结构。
VAMP：提供VAMP模块中的工具，可以使用半经验量子力学算法模拟气体和溶液中的反应和性质。
Window菜单
Window菜单包括组织显示打开文档窗口的命令。
Window菜单
它包括以下菜单项：
Tile Horizontally：水平平铺所以打开的文档窗口。 Tile Vertically：垂直平铺所有打开的文档窗口。 Cascade：重叠显示当前工程中打开的窗口。
Arrange Icons：在窗口左边整齐显示所有最小化的窗口。 Close All：关闭当前工程中所有打开的窗口。
Windows….：打开Windows对话框，管理已经打开文档的窗口。
Help菜单
Help菜单包括获得Materials Studio帮助系统或其它在线信息的命令。
Help菜单
它包括以下菜单项：
Help Topics：显示Materials Studio Help Viewer。所有帮助主题都列在目录栏。 Using Help：显示怎样使用帮助的主题。
Getting Started：显示开始使用Maerials Studio的帮助主题，包括： ? 安装和系统需求。 ? 许可。
? 从老版本升级。 ? 简单演示
Tutorials：显示已安装Materials Studio模块的演示。 Accelys on the Web：浏览Accelrys主页。
Materials Studio Home Page：浏览Materials Studio主页 About：显示有关Materials Studio安装的信息。
Explorers菜单
Materials Studio集成了几个管理器。可以快速方便的浏览显示数目较多的条目。Materials Studio包括以下管理器。
? Project Explore ? Properties Explore ? Job Explore
Project Explore
Materials Studio运行你组织逻辑上有关的文档成一个集合，称之为工程。可以使用Project Explore查看属于一个工程的文档。
Project Explore
Project Explore在Materials Studio启动时默认打开的。View|Explorers|Project Explorer菜单命令可以控制它的显示。
Project Explorer中包括一个工程管理明理的快捷工具条，和工程文档和目录的管理器方式的视图。在一项上面右击鼠标，显示工程管理器快捷菜单，包含所有适用的命令。
一些Materials Studio模块运行你自动或使用Modules工具条或Modules菜单中的Save Settings…选项在一个特定类型文档中保存它们的当前设置。这种文件在Project Explorer中以蓝色并以相应模块的图标显示，它名字后面加上相应工具的名字。
Materials Studio工程使用当前文件夹的概念。当Materials Studio创建或导入文档时，文档放在当前文档目录中。当前目录是这样确定的：
1. 如果一个文件夹或最高级别的工程项选定，它就是当前文件夹。 2. 如果选择的是一个文档，它所在的目录就是当前目录。 当前目录在Project Explore中以黑体显示。 提示：Materials Studio创建的文档拥有不同的扩展名（如：.xsd，.xgd，.txt等），在Project Explorer中同时看到文件名和扩展名是很有用的。
如果Project Explore没有显示文件扩展名（如显示3D Model Document，而不是3D Model Eocument.xsd），你可以在Windows浏览器中修改文件夹选项。如下：
1. 在Windows浏览器中（操作系统显示文件的窗口）中选“视图”菜单（在Windows
Me和更新的系统中选“工具”菜单）。 2. 在文件夹选项对话框中“查看”选项卡。 3. “隐藏已知文件类型的扩展名”项不要选住。 4. 按“确定”按钮。
5. 从启动Materials Studio。
Properties Explorer
Properties Explore显示在三维文档或图形文档中选定的对象的属性。对象包括图形标记、原子、键、分子等。当选择多个对象时，显示它们的共同属性。
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