南方农业学报JournalofSouthernAgriculture2018,49(2):208-213·208·南方农业学报ISSN2095-1191;CODENNNXAABhttp://www.nfnyxb.com49卷DOI:10.3969/j.issn.2095-1191.2018.02.02橡胶树三倍体的2n配子来源及发生途径鉴定
张源源,方家林,黄
海南儋州
肖,李维国,安泽伟
571737)
(中国热带农业科学院橡胶研究所/国家橡胶树育种中心/农业部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室,
摘要:【目的】明确形成三倍体橡胶树云研77-2和云研77-4的2n配子来源及发生途径,为利用天然2n配子杂交选育多倍体新品种提供参考。【方法】以三倍体橡胶树云研77-2和云研77-4及其亲本为试验材料,通过SSR分子标记鉴定其2n配子来源及发生途径,并分析2n配子传递亲本的杂合性。【结果】分别通过4个位点可判定形成云研77-2和云研77-4的2n配子来源于母本GT1,无位点判定2n配子来源于父本PR107。从8个位点判定形成云研77-2的2n配子发生途径为第一次减数分裂核复原(FDR),从2个位点判定形成云研77-2的2n配子发生途径为第二次减数分裂核复原(SDR),形成云研77-2的2n配子发生途径为FDR的概率为80.00%。从8个位点判定形成云研77-4的2n配子发生途径为FDR,从3个位点判定形成云研77-4的2n配子发生途径为SDR,形成云研77-4的2n配子的发生途径为FDR的概率为72.73%。形成云研77-2和云研77-4的2n配子分别传递亲本60%和70%的杂合性。【结论】形成云研77-2和云研77-4的2n配子均来源于母本GT1,且其发生途径均为FDR。
关键词:橡胶树;三倍体;2n配子;发生途径;第一次减数分裂核复原(FDR);第二次减数分裂核复原(SDR)
中图分类号:S794.104
文献标志码:A
文章编号:2095-1191(2018)02-0208-06
Sourcesandformationpathwayidentificationof2ngametesin
triploidrubbertrees
ZHANGYuan-yuan,FANGJia-lin,HUANGXiao,LIWei-guo,ANZe-wei
(RubberResearchInstitute,ChineseAcademyofTropicalAgriculturalSciences/StateCentreforRubberBreeding/Key
LaboratoryofBiologyandGeneticResourcesofRubberTree,MinistryofAgriculture,Danzhou,Hainan571737,China)Abstract:【Objective】Thesourcesandformationpathwayof2ngameteswhichformedtriploidrubbertreesYunyan77-2andYunyan77-4werestudiedtoprovidereferenceforhybridizationbreedingofpolyploidnewvarietiesusingnatu-ral2ngametes.【Method】TriploidrubbertreesYunyan77-2,Yunyan77-4andtheirparentswereusedastestmaterials.Thesourcesandformationpathwayof2ngameteswereidentifiedbySSRmarkers,andheterozygosityoftransferparentsof2ngameteswereanalyzed.【Result】Sourcesof2ngameteswhichformedYunyan77-2andYunyan77-4derivedfromfemaleparentGT1wereidentifiedbyfourlocirespectively,whiletherewasnolocuswhichdeterminedthat2ngametesderivedfrommaleparentPR107.Eightlocideterminedthattheformationpathwayof2ngameteswhichformedYunyan77-2wasthefirstdivisionrestitution(FDR),twolocideterminedthattheformationpathwayof2ngameteswhichformedYunyan77-2wasseconddivisionrestitution(SDR).Theprobabilityof2ngameteformingYunyan77-2throughFDRwas80.00%.Eightlocideterminedthattheformationpathwayof2ngameteswhichformedYunyan77-4wasFDR,threelocideterminedthattheformationpathwaywasSDR,theprobabilityof2ngameteformingYunyan77-4throughFDRwas72.73%.The2ngameteswhichformedYunyan77-2andYunyan77-4transferred60%and70%heterozygosityofthepa-rentsrespectively.【Conclusion】The2ngameteswhichformYunyan77-2andYunyan77-4alloriginatefromthefemaleparentGT1,andtheformationpathwayof2ngametesisFDR.
Keywords:rubbertree;triploid;2ngamete;formationpathway;firstdivisionrestitution(FDR);seconddivisionrestitution(SDR)
0引言
【研究意义】三倍体可通过二倍体和四倍体杂
交或未减数配子(2n配子)杂交获得(Ramseyand
Schemske,1998;吴雪娟等,2016)。根据遗传效应不
收稿日期:2017-10-25
基金项目:海南省自然科学基金项目(317281)作者简介:张源源(1989-),主要从事橡胶树多倍体育种和诱变育种研究工作,E-mail:yuanyuanhill@sina.com。
2期张源源等:橡胶树三倍体的2n配子来源及发生途径鉴定
·209·同,2n配子发生途径可分为第一次减数分裂核复原(Firstdivisionrestitution,FDR)和第二次减数分裂核复原(Seconddivisionrestitution,SDR)两种,其中FDR途径可传递亲本70%~80%的杂合性,SDR途径可传递亲本30%~40%的杂合性(康向阳和王君,及其母本GT1和父本PR107。云研77-2和云研77-4是从GT1×PR107双无性系自然授粉的杂交子代中通过苗期耐寒筛选获得(李惠波等,2009)。高效植物基因组DNA提取试剂盒(DP350)购自天根生化科技(北京)有限公司;Hi-Di去离子甲酰胺、POP-7Poly-2010),传递亲本杂合性的差异决定了不同发生途径2n配子在多倍体育种中具有不同的应用价值。因此,研究橡胶树三倍体的2n配子来源及发生途径对利用其亲本开展多倍体育种具有重要意义。【前人研究进展】分子标记是2n配子来源及发生途径鉴定的常用手段之一,通过筛选亲本中的杂合性标记位点,对其2n配子中的等位基因配置进行比较分析,可快速确定2n配子的遗传组成(张正海和康向阳,2006)。Chen等(2008)应用4个SSR标记分析鉴定出柑橘异源三倍体来源于FDR途径产生的2n雌配子。Ferrante等(2010)通过多个柑橘二倍体亲本与四倍体品系杂交获得了四倍体子代,并应用6个SSR标记研究鉴定其2n配子的发生途径,结果发现不同亲本分别通过不同发生途径(FDR或SDR)产生杂合或纯合的2n配子。Xi等(2012)应用21个SSR标记分析鉴定出3株黑杨异源三倍体均来源于FDR途径产生的2n雌配子。Dong等(2014)、旻昱等(2017)研究表明,采用少量位于着丝粒附近的低重组率SSR分子标记可检测青杨杂种多倍体的遗传组成,也可鉴定出毛白杨杂种三倍体的2n雌配子来源及发生途径。Yao等(2016)应用25个SSR标记鉴定出通过SDR途径产生的2n雌配子是橡胶树GT1自然授粉子代三倍体的唯一来源。【本研究切入点】橡胶树云研77-2和云研77-4具有较母本GT1生长速度快、产量高、抗性强(敖硕昌等,1998)和高度不育的特性(李惠波,2006),经染色体计数确认为纯合三倍体,是世界上唯一大面积种植且应用于生产的多倍体橡胶树(李惠波等,2009)。由于橡胶树纯合三倍体的唯一来源途径是2n配子和n配子杂交,但目前尚无形成云研77-2和云研77-4的2n配子来源及发生途径的相关研究报道。【拟解决的关键问题】以三倍体橡胶树云研77-2和云研77-4及其亲本为试验材料,通过SSR分子标记鉴定形成其三倍体的2n配子来源及发生途径,分析2n配子传递亲本的杂合性,为解释云研77-2和云研77-4具有优良性状的原因及利用其亲本的2n配子杂交选育多倍体新品种提供参考。
1材料与方法
1.1
试验材料
供试材料为三倍体橡胶树云研77-2、云研77-4
mer、GS-500LIZ分子量内标、毛细管电泳10×Buffer和2×TaqPlusPCRMasterMix购自AppliedBiosys-tems公司。1.2
试验方法
1.2.1
基因组DNA提取
称取云研77-2、云研77-4、母本GT1和父本PR107的嫩叶300mg,参照高效植物基因组DNA提取试剂盒使用说明提取基因组DNA。1.2.2
SSR引物筛选及合成
通过毛细管电泳检
测,从30对在橡胶树中具有多态性位点的引物中,筛选出13对本研究对象中具有多态性的引物,其序列及文献来源见表1。引物5'端连接TAMRA、HEX、FAM或ROX荧光标记,并由北京睿博兴科生物技术有限公司合成。1.2.3
PCR扩增
反应体系10.0μL:DNA模板
0.5μL,TaqPlusPCRMasterMix5.0μL,10μmol/L上游引物0.1μL,10μmol/L下游引物0.1μL,无菌水补足10.0μL。扩增程序:94℃预变性5min;95℃30s,50~60℃30s,72℃30s,进行35个循环;72℃延伸10min。PCR产物于4℃保存。1.2.4
毛细管电泳检测和SSR分析
4种PCR产物
TAMRA、HEX、FAM和ROX荧光标记)各0.3μL、分子量内标0.5μL和去离子甲酰胺9.5μL混合后加入PCR板,95℃变性5min,4℃冷却,于ABI-3730XL基因分析仪上检测。检测结果使用Gene-MarkerV2.20读取分析。1.2.5
2n配子来源和发生途径鉴定
理论上,不
考虑无效等位基因和等位基因丢失的情况,三倍体含有提供2n配子亲本的2个及以上等位基因。因此,当同一亲本所有的基因位点均与三倍体子代含有2个及以上相同等位基因时,可确定该亲本为三倍体的2n配子供体。不考虑同源重组的情况下,FDR途径产生的2n配子含有亲本的所有等位基因,SDR途径产生的2n配子含有亲本50%等位基因。因此,确定2n配子来源后,若三倍体在所有的基因位点均含有提供2n配子亲本的所有等位基因时,则2n配子发生为FDR途径,反之为SDR途径。如图1所示,在HSSR013位点,母本GT1等位基因为abc,父本PR107的等位基因为bb,云研77-4的等位基因为abbc,可判
(即连接·210·表1SSR引物序列及参考文献来源
Table1SSRprimersequenceandreferencesources
位点LocusHB-1HSSR006HSSR012HSSR013EHB034EHB070EHB087EHB133EHB159EHB177EHB065
unigene17757HESR055
南方农业学报49卷引物序列Primersequence
F:5'-CTGATGCTGCCAAGCAATAC-3';R:5'-CAAACATCGCACTCTCCTCA-3'F:5'-ACCTCGATCCACAAACGAAC-3';R:5'-CTGAGGGCGTAAGAATCGAA-3'F:5'-CCGCCTCAAGAAGAACAAAG-3';R:5'-TCCCCTCGAGAGCTTATCAA-3'F:5'-CCGGGATGATTTTGAGAAAG-3';R:5'-GATCCTGAAGCTCTGAGAGAA-3'F:5'-ATAGCCGACCCCAAATTCTT-3';R:5'-GGACAGCAAGACATGAAGAGTG-3'F:5'-CCCCACATGCGATTTAAGTT-3';R:5'-TGGGCTGTGTTGTGCTATTC-3'F:5'-CGGAGCTAAGTTCGAGTCCTT-3';R:5'-CTGGAACCGTATTTCCAGGT-3'F:5'-GGCCATCACTCAACATCCTT-3';R:5'-CTCACCCTTTTGAAAGCGAA-3'F:5'-TACCAAGCATGTTGCCCATA-3';R:5'-TCTCAGAAACAAGGGTTGGG-3'F:5'-TCGCTTTCTCCATATAGAGTTTCA-3';R:5'-CAGCAAGAAATCCCTCAACC-3'F:5'-CCAGTGAGCACAGGCATAAT-3';R:5'-TGGAGAGTGCAGATGAATGC-3'F:5'-GACTTGCCTCTCCCAGACC-3';R:5'-CCTTATCCTATCTTTTGTTTTCC-3'
F:5'-TTGCTGAGATGTGATG-3';R:5'-GAGGTTTAACTGCTAAG-3'重复单元
Repeatunit(TG)n(CG)n(GAT)n(CT)n(AGTTG)n(AAG)n(ATT)n(CTT)n(CA)n(GAA)n,(TTC)n(AAT)n(GA)n(GAA)n
文献来源
ReferenceSouzaetal.,2009安泽伟等,2009安泽伟等,2009安泽伟等,2009Triwitavakornetal.,2011Triwitayakornetal.,2011Triwitayakornetal.,2011Triwitayakornetal.,2011Triwitayakornetal.,2011Triwitayakornetal.,2011Triwitayakornetal.,2011
Lietal.,2012Anetal.,2013
断2n配子来源于母本GT1,且云研77-4含有亲本GT1
的所有等位基因,可判断2n配子发生途径为FDR。
2608.0006.0004.0002.000
0
GT1
a
265
HSSRO13270
275b
280
2结果与分析
2.1
基因组DNA提取结果
4个供试材料的基因组DNA浓度为68.55~335.15ng/μL,OD260/OD280为2.007~2.119,其琼脂糖凝胶电泳检测结果(图2)表明,提取的基因组DNA质量较好,条带完整,可用于后续试验。
M
1
2
3
4
5
6
7
8
9
c
266.9
260
6.000
5.0004.0003.0002.0001.000
0
PR107
265
270
274.4276.3275bb
280
274.5
260
6.0004.0002.000
0
266.7
274.2276.2
a
云研77-4
265
270
275bb
c
280
图2基因组DNA扩增电泳结果
Fig2GenomicDNAamplificationelectrophoresisresults
M:DNAMaker;1~5:其他橡胶树品系;6:PR107;7:GT1;8:云研77-4;9:云研77-2M:DNAMaker;1-5:Otherrubbertreestrains;6:PR107;7:GT1:8:Yunyan77-4;9:Yunyan77-2
图1
云研77-2、云研77-4及其亲本在HSSR013位点的等位
基因配置
Fig.1AllelestatusofYunyan77-2,Yunyan77-4andtheirpa-rentsatlocusHSSR013
2.2
1.2.62n配子传递亲本杂合性分析在确定2n配
子来源及发生途径后,可直接读取2n配子的基因型,计算2n配子传递亲本的杂合性(Rateofmaternalheterozygosity,HR)。2n配子传递亲本的杂合性计算公式为:
HR(%)=nab(/nab+naa+nbb)×100
其中,n为2n配子数,ab表示杂合基因型2n配子,aa和bb表示纯合基因型2n配子(Xieetal.,2014)。
SSR引物筛选结果
毛细管电泳检测结果表明,从30对引物中筛选出的13对引物在三倍体云研77-2和云研77-4中处于杂合状态且在其父母本中具有差异条带,筛出率为43.33%(表1)。利用13对引物对4个供试材料进行PCR扩增,共扩增出33条差异性条带,平均每对引物扩增出2.5个条带,每个位点的等位基因数为2~3个,其中6个位点有2个等位基因,7个位点有3个等位基因。2.32n配子来源鉴定结果
如表2所示,通过HB-1、HSSR012、EHB133和EHB177位点可判定形成云研77-2的2n配子来源于
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