南方农业学报JournalofSouthernAgriculture10期2095-1191;ISSNCODENNNXAAB2017,48(10):1741-1747DOI:10.3969/j.issn.2095-1191.2017.10.03·1741·http://www.nfnyxb.com茶树甲羟戊酸激酶基因CsMVK克隆
及表达特性分析
王鹏杰,陈
丹,曹红利,姚雪倩,陈
笛,杨国一,郑知临,叶乃兴*
350002)
(福建农林大学园艺学院/茶学福建省高校重点实验室,福州
摘要:【目的】克隆茶树甲羟戊酸激酶基因(CsMVK),分析其生物学信息及在不同组织及乌龙茶做青过程中的表达特性,为研究茶叶加工过程中香气形成机制提供参考。【方法】RT-PCR扩增CsMVK基因,应用生物信息学软件对其编码蛋白(CsMVK)的氨基酸序列进行预测分析,通过实时荧光定量PCR(qPCR)分析CsMVK在茶树不同组织及乌龙茶做青过程中的表达特性。【结果】克隆获得的CsMVK基因(GenBank登录号MF668187)全长1455bp,开放阅读框(ORF)长度为1164bp,编码387个氨基酸,蛋白质分子量41.18kD,理论等电点(pI)5.88。CsMVK蛋白具有GHMP_kinases_Ndomain和GHMP_kinases_Cdomain2个功能结构域,定位于细胞质中,不存在跨膜结构和信号肽。系统发育进化树分析结果显示,CsMVK与三七、常春藤的MVK聚为一类,表明茶树与三七、常春藤的亲缘关系最近。qPCR检测结果显示,CsMVK基因在果实中的表达量显著高于其他组织(P<0.05,下同),在不同组织中的表达量排序为:果实>根>叶>茎>花;在乌龙茶做青过程中,从鲜叶到晒青叶,CsMVK基因的表达量上升,晒青到一摇过程中表达量下降,经过3次摇青,其表达量持续升高并在杀青前达最大值,与其他做青阶段差异显著。【结论】CsMVK基因表达与茶叶香气品质形成有关。
关键词:茶树;甲羟戊酸激酶(MVK);乌龙茶;做青;表达特性;香气中图分类号:S571.103.53
文献标志码:A
文章编号:2095-1191(2017)10-1741-07
Cloningandexpressionofmevalonatekinasegene
CsMVKinteaplant
WANGPeng-jie,CHENDan,CAOHong-li,YAOXue-qian,CHENDi,
*
YANGGuo-yi,ZHENGZhi-lin,YENai-xing
(CollegeofHorticulture,FujianAgricultureandForestryUniversity/KeyLaboratoryofTeaScienceatUniversitiesin
Fujian,Fuzhou350002,China)Abstract:【Objective】Mevalonatekinasegene(CsMVK)fromteaplantwascloned,anditsbiologicalinformation
andexpressionindifferenttissuesandOolongteaduringfinemanipulationprocedurewereanalyzed,toprovidetheoreti-calbasisforexploringtheformationmachanismofaromaduringteaprocessing.【Method】GeneCsMVKwasamplifiedbyRT-PCR,andtheaminoacidsequenceofitsencodedprotein(CsMVK)waspredictedbybioinformaticssoftware.Ex-pressionsofgeneCsMVKindifferenttissuesofteaplantandOolongteaduringfinemanipulationprocedurewereana-lyzedbyreal-timefluorescencequantitativePCR(qPCR).【Result】Thefull-lengthcDNAofclonedgeneCsMVK(Gen-BankaccessionnumberMF668187)was1455bpinlength,containinga1164bpopenreadingframe(ORF)encoding387aminoacids.Theproteinmolecularwas41.18kDandtheoreticalisoelectricpoint(pI)5.88.ProteinCsMVcontainedtwofunctionaldomains,GHMP_kinases_NdomainandGHMP_kinases_Cdomainfunctionaldomain.Itwasprimarilylocatedincytoplasm,withnotransmembranestructureandsignalpeptide.ThephylogenetictreeanalysisshowedthatCsMVKandMVKofPanaxnotoginsengandHederahelixbelongedtothesamecategory,whichindicatedthatteaplant,P.notoginsengandH.helixhadtheclosestgeneticrelationship.AccordingtoqPCRdetection,expressionofgeneCsMVKinfruitwassignificantlyhigherthanthoseinothertissues(P<0.05,thesamebelow).TheorderofgeneCsMVKexpressionlevelswasfruit>root>leaf>stem>flower.DuringfinemanipulationprocedureofOolongtea,expressionofgeneCsMVK收稿日期:2017-08-17基金项目:福建省“2011协同创新中心”中国乌龙茶产业协同创新中心专项项目(闽教科〔2015〕75号);国家现代农业(茶叶)产业
技术体系建设专项资金项目(CARS-19);福建农林大学科技创新专项基金项目(CXZX2016117,CXZX2017181)
作者简介:*为通讯作者,叶乃兴(1963-),教授,主要从事茶树栽培育种与品质调控研究工作,E-mail:ynxtea@126.com。王鹏杰
(1993-),研究方向为茶树栽培育种与生物技术,E-mail:494928025@qq.com
·1742·南方农业学报48卷up-regulatedfromleavestosolarwitheringanddown-regulatedfromsolarwitheringtofirsttumblings.Throughthreetum-blings,theexpressionofgeneCsMVKreacheditspeakbeforefixationandshowedsignificantdifferencewithotherstages.
【Conclusion】ExpressionofgeneCsMVKmightberelatedtoaromaformationinteaprocessing.
Keywords:teaplant;mevalonatekinase(MVK);Oolongtea;finemanipulationprocedure;expressioncharacteris-tics;aroma
0引言
【研究意义】茶树[Camelliasinensis(L.)O.Kun-tze]属山茶科山茶属,为多年生常绿木本植物。我国
是茶树的故乡和茶文化发祥地,目前世界上有60个国家引种了茶树(叶乃兴,2010)。茶叶作为天然、健康且富有文化内涵的饮品,在人类生活中一直扮演着重要角色(叶乃兴,2010;王丽等,2016)。萜类化合物是茶叶的主要香气成分,对其品质有重要影响徐燕,2013)。萜类化合物合成途径复杂,主要通过甲羟戊酸(Mevalonatepathway,MVA)途径和2-C-甲基-D-赤藻糖醇-4-磷酸(MEP)途径合成,均由多种酶参与合成调控。其中,存在于细胞质中的MVA途径参与倍半萜、三萜、类胡萝卜素等次生代谢产物的生物合成,对茶叶的香型和品质影响较大(张冬桃等,2015)。甲羟戊酸激酶(Mevalonatekinase,MVK)是MVA途径的关键限速酶之一,其作为MVA途径酶促反应中第一个ATP依赖酶,负责把三磷腺苷中的磷酸基团转移到MVA的第5位羟基上形成甲羟戊酸-5-磷酸并释放ADP,最终生成异戊烯焦磷酸(Isopente-nylpyrophosphate,IPP),该化合物是合成萜类物质的前体物质(PotterandMiziorko,1997;LangeandCroteau,1999;ChuandLi,2003a)。因此,开展茶树MVK基因的克隆及表达特性研究,对了解茶树萜类化合物的形成及茶叶香气的影响具有重要意义。【前人研究进展】自1994年Riou等首次从拟南芥中克隆出MVK基因以来,又陆续从甜瓜(Deleuetal.,2007)、玉米(Alexandrovetal.,2009)、长春花(Sim-kinetal.,2011)、丹参(Maetal.,2012)等多种植物中克隆获得MVK基因。Champanoy和Tourte(1998)将酵母MVK基因转入烟草,结果表明,其能加速烟草植株再生过程、侧芽生长和开花习性,并提高叶绿素和淀粉含量。Lluch等(2000)研究发现,拟南芥MVK基因在其根部和花序中表达较高,且MVK基因5'端序列-295~-194区域的调控元件影响MVK基因高表达。Schulte等(2000)将长春花MVK蛋白进行分离纯化,结果表明,MVK基因受代谢产物反馈抑制调节。乌云塔娜等(2014)对杜仲MVK基因启动子进行分析,发现其含有大量基本顺式调控元件TATbox、CAATbox及光响应、生长素响应等相关顺式调控元件。【本研究切入点】目前,鲜见有关茶树MVK基因克
隆及表达特性的研究报道,限制了对茶树萜类化合
物合成机理的深入研究。【拟解决的关键问题】克隆CsMVK基因,对其进行生物信息学分析,实时荧光定量PCR(qPCR)检测CsMVK基因在不同组织及乌龙茶做青过程中的表达特性,为研究茶叶加工过程中香气形成机制提供参考。
1材料与方法
1.1
试验材料主要试剂:多糖多酚植物总RNA提取试剂盒购于天根生化科技(北京)有限公司;pEASYT?-T1载体、T1感受态细胞、TransTaqHiFiDNAPolymeraseTransstart?TipGreenqPCRSuperMix试剂盒和逆转录试剂盒购自全式金生物技术(北京)有限公司。1.2样品采集
于2016年9月上旬~2017年4月下旬从福建农林大学教学茶场中采集茶树品种铁观音植株的根、茎、叶、花和果实,用于不同组织MVK基因的表达检测,并采集其中小开面二三叶,按陈林等(2014)的方法进行做青,并分别对鲜叶、晒青叶及一摇后、二摇后、三摇后和杀青前的叶片进行取样,用于乌龙茶做青过程中的表达特性检测。上述样品均设3次重复,锡箔纸包裹标记,液氮速冻后于-80℃保存备用。1.3总RNA提取及cDNA合成
参照多糖多酚植物总RNA提取试剂盒说明提取样品总RNA,用1%琼脂糖凝胶电泳检测总RNA质量,使用逆转录试剂盒将其反转录合成cDNA。1.4CsMVK基因克隆
从铁观音茶树芽叶转录组测序的数据库(王鹏杰等,2017)中筛选出与MVK基因同源性较高的表达序列标签(EST)序列,并进行BLASTx比对分析,核查其是否具有完整开放阅读框(ORF),并设计其RT-PCR引物(表1)。RT-PCR扩增参考王鹏杰等(2017)的方法,以铁观音芽叶cDNA为模板,扩增产物用1%琼脂糖凝胶电泳检测。参照姚雪倩等(2017)的方法进行PCR产物回收、连接及转化,将阳性克隆送至上海铂尚生物技术有限公司测序。1.5生物信息学分析
在NCBI中搜索CsMVK基因ORF并进行同源性分析;利用ProtParam、TMHMM2.0、SignalP、SMART、
(10期王鹏杰等:茶树甲羟戊酸激酶基因CsMVK克隆及表达特性分析·1743·表1引物名称及其序列
Table1Primernamesandtheirsequences
引物名称PrimerCsMVK-RT-FCsMVK-RT-RCsMVK-qRT-FCsMVK-qRT-RCsGAPDH-qRT-FCsGAPDH-qRT-R
序列Sequence
5′-ATGGAGGTGAGAACAAGAGC-3′5′-ATCAGGACGAAGAGTGGAAG-3′5′-CAAAAGTTGGCCGGAACACA-3′5′-AGAATGGTCGCCACTTCGTT-3′5′-TTGGCATCGTTGAGGGTCT-3′5′-CAGTGGGAACACGGAAAGC-3′
用途FunctionRT-PCRCsMVK基因qPCR检测内参基因qPCR检测
TargetP1.1Server、PORTER和SWISS-MODEL分别对CsMVK蛋白进行理化性质、跨膜结构、信号肽、功能域、亚细胞定位、二级结构和三级结构预测分析,并使用PyMOL编辑三级结构;采用MEGA5.0构建系统发育进化树。1.6qPCR检测
利用CsMVK-qRT-F和CsMVK-qRT-R引物(表1),参照Transstart?TipGreenqPCRSuperMix试剂盒说明对CsMVK基因在不同组织及乌龙茶做青过程的相对表达量进行qPCR检测,以茶树GAPDH为内参基因,其引物(CsGAPDH-qRT-F和CsGAPDH-qRT-R)见表1。采用2-??Ct法(Schafferetal.,2001)分析检测结果。通过Excel2013和GraphPadPrism6进行数据分析和制图,同时采用SPSS20.0进行差异显著性分析。
2结果与分析
2.1
CsMVK基因克隆及序列分析结果
以铁观音芽叶cDNA为模板,RT-PCR产物用1%琼脂糖凝胶电泳检测,结果显示,扩增条带长度约1400bp,与预期结果一致(图1)。测序结果经BLASTx比对显示,该序列全长1455bp,编码完整的MVK蛋白,与其他植物的MVK基因相似度极高,GenBank登录号为MF668187,包含1164bp的ORF189~1352bp),编码387个氨基酸(图2)。2.2CsMVK蛋白生物信息学分析结果
理化性质分析结果显示,CsMVK蛋白分子式为C1828H2954N782O482S17,分子质量为41.18kD,等电点(pI)为5.88,含有20种氨基酸,其中亮氨酸(Leu)、丙氨酸Ala)和丝氨酸(Ser)的比例较高,分别为11.9%(46个)、9.8%(38个)和9.6%(37个);不稳定系数为30.26,总平均亲水性为0.166,疏水性域比亲水性域大,推测该蛋白为稳定的疏水蛋白。
跨膜结构和信号肽预测结果显示,CsMVK蛋白无跨膜结构和信号肽,属于在细胞内发挥生理作用的非分泌蛋白。亚细胞定位预测结果表明,该蛋白定位于细胞质,由此推测CsMVK在细胞质中合成后无蛋白转运,未分泌到细胞外而直接在细胞质中结M
1
2000bp
1000bp
图1茶树CsMVK基因PCR扩增结果
Fig.1PCRamplificationofgeneCsMVKinteaplant
M:DNAMarker;1:CsMVK基因GeneCsMVK
合底物生成甲羟戊酸-5-磷酸(Mevalonate-5-phos-phate,MVAP),为下一步合成萜类化合物共同前体
物质即IPP。
功能域预测结果表明,CsMVK蛋白由3个保守区组成,分别为低复杂度区域(Lowcomplexityregion,位于47~56aa)、GHMP激酶N端保守区(GHMP_ki-nases_Ndomain,位于131~212aa)和GHMP激酶C端保守区(GHMP_kinases_Cdomain,位于288~368aa),其中后面2个保守区为所有MVK蛋白共有的功能域,可结合底物和ATP并进行催化反应(图3)。
CsMVK蛋白的二级结构预测结果显示,无规则卷曲占44.19%,α-螺旋占40.83%,β-折叠占14.99%。利用SWISS-MODEL构建CsMVK蛋白的三级结构,基于人类MVK蛋白为模板进行建模,二者序列相似性达42.86%,GMQE值为0.70,表明预测结果较理想。使用PyMOL对其进行编辑,结果如图4所示,GHMP激酶保守区分别位于蛋白两端,能结合底物和ATP并进行催化反应,发挥功能性作用。2.3CsMVK蛋白系统发育分析结果
将CsMVK蛋白的氨基酸序列进行BLASTp比对,结果显示,其与马铃薯(XP_006361859.1)、番茄XP_004230181.1)、辣椒(XP_016538569.1)、芝麻XP_011092024.1)和烟草(XP_016441034.1)等植物MVK蛋白序列的相似性较高,分别为80%、80%、78%、78%和77%(图5)。
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