分子动力学模拟方法研究蛋白质与纳米颗粒的相互作用

分子动力学模拟方法研究蛋白质与纳米颗粒的相互作用

左光宏

【期刊名称】《科研信息化技术与应用：中英文》 【年(卷),期】2011(002)005

【摘要】分子动力学方法是基于分子力场，通过数值求解牛顿动力学方程来模拟原子与分子运动的计算机模拟方法。利用分子动力学能模拟分子系统与时间相关演化轨迹，研究分子系统的热力学与动力学性质。随着计算机技术的高速发展，分子动力学模拟被广泛的应用于生物分子与纳米材料研究。本文以单壁碳纳米管与WW蛋白结构域为例，介绍如何使用分子动力学模拟研究蛋白质与纳米颗粒之间的相互作用。研究发现，单壁碳纳米管能够插入到蛋白质的核心中，且正好阻挡了YAP65WW蛋白结构域的功能位点，从而可能导致YAP65WW蛋白结构域功能的丧失。结果表明，分子动力学模拟提供了一种全新的从分子层次上研究纳米颗粒毒性机制的方法。 【总页数】9页(P.63-71)

【关键词】蛋白质;纳米颗粒;分子动力学;纳米毒性 【作者】左光宏 【作者单位】; 【正文语种】英文 【中图分类】O316 【相关文献】

1.纳米颗粒与蛋白质分子的相互作用 [J], 许志珍; 晏晓敏; 张杰; 王煜倩; 唐仕川; 钟儒刚

2.分子动力学模拟碳纳米管与蛋白质中功能基团的相互作用 [J], 杨鹏军; 金邦坤; 朱平平; 杨海洋

3.蛋白质与小分子相互作用的动力学毛细管电泳研究 [C], 蒋宏贵; 邹小兵; 熊彩侨; 夏之宁

4.有机渗透剂介导的动力学毛细管电泳方法及蛋白质-DNA相互作用研究 [C], 李涛; 王智鑫; 汪海林

5.金纳米颗粒周围水的结构和动力学性质的分子动力学模拟 [J], 杨振; 杨晓宁; 徐志军

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