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毕赤酵母实验操作手册

来源:用户分享 时间:2025/6/4 4:47:41 本文由loading 分享 下载这篇文档手机版
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推荐:电压 1.5kV ;电容 25μF;电阻200Ω。电击时间为 4~10msec。

3.5 Pichia 3.5.1

酵母表达直接 PCR鉴定重组子的方法

模板的处理:

1. 平板上的菌落长到肉眼可见时(约 12 小时);

2. 将除了模板之外的其它 PCR反应液的组分准备好,并分装。引物最好使用Kit 中已有的检测专用的引物,或者一条使用载体上的引物,一条使用基因的特异性引物(这样做可以鉴定非定向克隆的方向);

3. 用半根灭菌的牙签 (节约,而且好用)挑取菌落 ,在 PCR管中涮以下, 放入一

个灭菌的 1.5 毫升离心管,对 PCR管和 1.5 毫升离心管编号; 4. PCR 扩增, 1% agarose 电泳;

5. 对于 PCR扩增显现特异性条带的克隆, 把置于 1.5 毫升离心管中的半截牙签扔到 5 毫升 YPDZ培养基中, 30 度培养, 8- 12 小时后提质粒,酶切鉴定确认。

注意:本试验方法应用在需要挑取的克隆较多(也就是克隆效率低),使用

PCR初

筛可以使工作量大为降低。

3.5.2 PCR 反应体系:

以 TaKaRa Taq DNA聚合酶反应为例:组分 50 μl 体系 20 μl 体系

10xReaction Buffer 5.0

μl 2.0

μ l

25mmol/L MgCl2 3.0 μl 1.2 μl

2.5mmol/L dNTPs 5.0 μl 3.0

μ l

μ l μ l

Primer 1 (10μ mol/L ) 2.5 μl 1.0 Primer 2 (10μ mol/L ) 2.5 μl 1.0

ddH2O 31.5μl 12.6 μl

Taq DNA聚合酶 0.5 μl 0.2

μ l

TOTAL 50.0μl 20.0 μl

3.5.3 PCR 反应条件:

初始变性 94 ℃ 4min

变性 94 ℃ 30s 34

个循环

退火 50~54 ℃ 30s

延伸 72 ℃ 30s

结束延伸 72 ℃ 10min

保存 4℃

3.6 毕赤酵母基因组提取方法 ⑴ 接种重组和空质粒转化子于 30℃,培养 16~ 18 小时。

5ml YPDZ培养基, GS115 菌于 YPD培养基作对照,

⑵ 室温下, 1500 g 离心 5-10min 收集菌体

⑶ 100 ulTE ( pH 7.0 )重悬,加入 300 ul EDTA (pH 8.0 ), 0.07M Tris -HCl, 3

ul β- 巯基乙醇, 1ul Lyticase

,37℃水浴 30 min 。

⑷ 10000g 离心 5~10min,取沉淀,加 90ul TE 重悬。

⑸ 200ul 饱和酚, 200ul 氯仿,混匀,离心 30s ,取上层水相。

⑹ 加入两倍体积无水乙醇以及

1/10 体积的 NaAC, -20 ℃放置 30min;

⑺ 10000g 离心 20min,弃上清; 75%乙醇漂洗沉淀一次; ⑻ 干燥后,加入 15 μl的 TE或 H2O溶解, -20 ℃备用。

3.7 Mut+ 表型重组酵母的诱导表达实验

1. 挑选一单菌落,置于装有 25ml MGY、 BMG或 BMGY培养基的 250ml 摇瓶中,于

28-30 °C/250-300 rpm 培养至 OD600 = 2-6 (~16-18 h) ;

2. 室温下 1500~3000g离心 5min,收集菌体,用 MM、BMM或 BMMY重悬菌体,使

OD600 =1.0 左右(约 100~200ml);

3. 将步骤 2 所得的菌液置于 1L 的摇瓶中,用双层纱布或粗棉布封口,放置于 28-30 °C/250-300 rpm 的摇床上继续生长;

4. 每 24h 向培养基中添加 100% 甲醇至终浓度为 0.5 ~1.0%;

5. 按时间点分别取菌液样品,取样量为 1ml,置于 1.5ml EP 管中,最大转速离心 2~3min,分别收集上清和菌体,分析目的蛋白的表达量和菌液最佳收获时间。时间

点一般取: 0、6、12、24、36、 48、60、72、 84 和 96h;

6. 对分泌表达, 分离样品的上清液; 对胞内表达, 分离样品的菌体沉淀, 带检测

样品用液氮或干冰速冻后,于 -80 °C 保存备用;

7. 可以用 SDS-PAGE、Western-Blot 及活性实验检测与鉴定重组蛋白的表达。

3.7 Muts 表型重组酵母的诱导表达实验

1. 挑选一单菌落,置于装有 25ml MGY、 BMG或 BMGY培养基的 250ml 摇瓶中,于

28-30 °C/250-300 rpm 培养至 OD600 = 2-6 (~16-18 h)

2. 室温下 1500~3000g离心 5min,收集菌体,用 1/5 到 1/10 原培养体积的 MM、BMM 或 BMMY重悬菌体(约 10~20ml);

3. 将步骤 2 所得的菌液置于 100ml 的摇瓶中,用双层纱布或粗棉布封口,放置于

28-30 °C/250-300 rpm 的摇床上继续生长;

4. 每 24h 向培养基中添加 100% 甲醇至终浓度为 0.5 ~1.0%;

5. 按时间点分别取菌液样品,取样量为 1ml,置于 1.5ml EP 管中,最大转速离心 2~3min,分别收集上清和菌体,分析目的蛋白的表达量和菌液最佳收获时间。时间

点一般取: 0、24、48、72、 96 和 120h;

6. 对分泌表达, 分离样品的上清液; 对胞内表达, 分离样品的菌体沉淀, 带检测样

品用液氮或干冰速冻后,于 -80 °C 保存备用;

7. 可以用 SDS-PAGE、Western-Blot 及活性实验检测与鉴定重组蛋白的表达。

四 试验的注意事项

4.1 信号肽识别位点的设计

以质粒 pPICZαA 为例。在利用 PCR反应在外源基因两端引入酶切位点的试验中。如果质粒 pPICZαA 双酶切中丢失了 KEX2蛋白酶的酶切位点 Lys-Arg,应该在上游中,增加了编码 Lys、Arg 的密码子 AAA、AGA 。酵母细胞膜中中的 KEX2蛋白酶是

α -factor 信号肽的切割酶,它能有效识别酶切位点 Lys- Arg,通过对信号肽的切割使基因表达产物释放至胞外。

4.2 PCR 产物酶切保护碱基的设计

利用 PCR转换酶切位点,通过 P3、P4 两引物的扩增在 rhEGF的两端加上 XhoⅠ、XbaⅠ的识别位点和 5 个保护碱基。

根据限制性核酸内切酶的工作原理,内切酶首先需要结合到核苷酸序列上,并在上

面进行滑行,直至识别到酶切位点,为了能使内切酶有效的结合到序列上以利于其

的有效加工。 在利用 PCR进行酶切位点转换的时候, 通常应在 5' 端限制酶位点外再

加 3 个保护碱基 GC[6],防止引物合成中因为合成效率和纯化问题而导致的酶

切位点的残缺。

核苷酸保护碱基之为了保证限制型内切酶的工作效率,在其识别位点的两侧应该保证一定的旁侧序列,换言之,识别位点是限制型内切酶识别并特异性切割底物的必要而

不充分的条件。鉴于 NEB(NewEngland Biolabs) 公司在限制酶领域的总体研究 水平和对保护碱基方面的独到理解,在设计引物时可以参照NEB公司的产品目录后 面的附录: Cleavage to the end of DNA fragments

进行[ 7],但是,一些不常

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