几种模式生物密码对的偏好模式分析

几种模式生物密码对的偏好模式分析

王芳平，王志坚，方玉田（天水师范学院 物理与信息科学学院物理系，甘肃 天水741001）

【摘 要】摘要：目的：从进化的角度研究古菌、细菌和真核生物基因组中密码对的使用，得到密码对使用与生物进化的可能的规律。方法：生物统计学。结果：首先，比较了编码序列中密码对出现频数的观测值与理论值之差的分布，发现这种分布基本是随机的；其次，这个分布也表明密码对的使用普遍具有偏好性，且不同物种所偏好的密码对和偏好的程度是不同的；第三，终止密码对的使用也存在偏好性，对于同一个密码子与不同的终止密码组合时,其观察值与理论值的关系依赖于终止密码子的类型。结论：结果表明密码对的使用与基因组进化存在相关性。

【期刊名称】中国医学物理学杂志 【年(卷),期】2011(028)006 【总页数】5

【关键词】密码对；终止密码子；基因组 【文献来源】

https://www.zhangqiaokeyan.com/academic-journal-cn_chinese-journal-medical-

physics_thesis/0201223588408.html

前言

密码子的使用及其密码子上下文关联的研究是生物信息学研究的一个重要方面。早在1989年，生物学家从实验的角度发现大肠杆菌基因组中密码对的使用存在偏好性[1]。近年，随着基因组测序的大规模进行，产生了大量的生物基因组序列，因此，从全基因组的角度进行对密码对的非随机使用研究也有了进一步