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二周目在选择跳过动画之后回到了家里 下楼，爸爸给了船票
爸爸走后，米可利打来电话说要我们去找其他冠军的秘密基地 然后是看电视选择水都的颜色，建议选择不喜欢的那个 出门后小田卷博士带着来到研究所，升级全国图鉴
去水静市找米可利，就在一周目过不去的那个魅影摩天楼门口（水静市地图） 首先来到冬雪镇，化石迷的家里可以拿到第二块化石（冬雪镇地图） 同样是拿到得文公司二楼复活
冬雪镇向左穿过流星瀑布，这里的洞口内找到小赤和小绿，可以对话挑战 （流星瀑布附近114号路地图）
小赤精灵：Lv.62妙蛙花 Lv.62喷火龙 Lv.62水箭龟 Lv.62乘龙 Lv.63卡比兽 Lv.66皮卡丘 小绿在门口那里，差点漏掉，对话挑战
小绿精灵：Lv.62化石翼龙 Lv.62胡地 Lv.62怪力 Lv.63椰蛋树 Lv.63风速狗 Lv.63暴鲤龙 飞到茵郁市，在这里冲浪向下走，找到希罗娜的秘密基地（119号路地图） 与希罗娜对话可以挑战她
希罗娜精灵：Lv.62冰精灵 Lv.62假面蔷薇 Lv.62波克基斯 Lv.62鬼盆栽 Lv.63路卡利欧 Lv.64烈咬陆鲨
（裂空座/古拉顿/海皇牙捕抓地点攻略）
茵郁市左边的天气研究所，到二楼与研究员对话得知某处降雨（小夜为127号道路） 飞到绿岭市向下冲浪沿着右边岩石走，这里潜水下去 在有光的地方上浮，进入洞口 尽头可捕捉Lv.70海皇牙
再次回到天气研究所与研究员对话，得知某处天气干燥 飞到冬雪镇，向左走，这里多了处洞口 洞穴深处捕捉Lv.70古拉顿
茵郁市向右下走，这个洞里找到渡（120号路地图）
渡精灵：Lv.62刺龙王 Lv.62沙漠蜻蜓 Lv.62三头龙 Lv.62双斧战龙 Lv.63血翼飞龙 Lv.64快龙 冬雪镇向右走，冲上斜坡，这里找到阿戴克和爱丽丝（111号路地图）
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阿戴克精灵：Lv.62噬魂吊灯 Lv.62怪力 Lv.62狡猾天狗 Lv.62胡地 Lv.63战羽鹰 Lv.64焚翼蛾 艾莉丝在右下角
艾莉丝精灵：Lv.62沙漠蜻蜓 Lv.62三头龙 Lv.62七夕青鸟 Lv.62血翼飞龙 Lv.63快龙 Lv.64双斧战龙
随便提下，流星瀑布的大吾在这个多出来的洞内，可以去挑战（当然不去也没什么关系） （流星瀑布地图）
大吾精灵：Lv.61盔甲鸟 Lv.62青铜钟 Lv.62班吉拉 Lv.62摇篮百合 Lv.62太古盔甲 Lv.64巨金怪
小光在冠军之路的出口处，跟4.5版本一样，可以去挑战（冠军之路地图） 小光精灵：Lv.54七夕青鸟 Lv.54火爆兽 Lv.54巨龙花 Lv.54大力鳄 Lv.55沙奈朵 回去找米可利对话，这是接到了有挑战者来的电话（水静市魅影摩天楼门口） 脑海中响起了小赤等人的对话，回神后继续剧情 飞到精灵联盟接受挑战吧，与守门的两人对话 挑战者竟然是N，对话后进入战斗
N精灵：Lv.66雪妖女 Lv.66钢钻鼹鼠 Lv.66噬魂吊灯 Lv.66自爆磁怪 Lv.67索罗亚克 Lv.68三头龙
胜利后主角辞去了冠军的职位= = 然后……然后主角就醒了
漫长的回忆终于结束，现在位于阿克罗马的实验室内
然后是一段很长的剧情对话，要去寻找小遥小光，询问有关三日月之羽的事情 在门口的博士给了点小遥的线索
出门是在梦之实验室，古辰镇向右冲浪找到新增的变化洞窟（103号路及山洞地图） 洞内找到小遥，一见面就要精灵对战，好吧
小遥精灵：Lv.62电龙 Lv.63火焰鸡 Lv.63蜥蜴王 Lv.63巨沼怪
胜利后从小遥那里得到三日月之羽，再次对话可以无限挑战（等级不够千万别手欠QAQ） 小遥精灵（二次对话）：Lv.85电龙 Lv.85雪妖女 Lv.85蜥蜴王 Lv.85火焰鸡 Lv.85沙漠蜻蜓 Lv.85巨沼怪
橙华市左边的橙华森林，这个洋馆可以进入了（橙华森林地图）
在最深处找到小光，检查后发现有精灵在控制他，进入战斗（森林洋馆地图）
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小光精灵：Lv.62七夕青鸟 Lv.62火爆兽 Lv.62巨龙花 Lv.62大力鳄 Lv.63沙奈朵 回到一层的另一个门口，墙上开了个路口，踩白色地板传 送得到月食之羽，打败突然跳出的Lv.35噬魂吊灯
回到梦之实验室找到阿克罗马，即可开启梦世界，通过这里的床通往世界狭缝 ~~~~~~~~写在去梦世界之前~~~~~~~~ 去凯那市坐船（凯那市地图）
船上遇到亚希达，开启对战开拓区，在二号房间休息即可到达水静市 再次与水静市的水手对话可去南方小岛（去南方小岛的船票一周目已拿到） （水静市地图）
研究中间的装置可捕捉Lv.50拉帝欧斯（看电视时未选择的那只） 选择的另一只Lv.40拉迪亚斯在全地区随机遇（小夜是在沙漠） 飞到武斗镇，走上方的洞窟，这里的洞口出现了（武斗镇洞窟地图） 进洞回答问题，选择否，得到破坏因子
飞到茵郁市，向右走，在水池里冲浪到达这里的洞（120号地图） 洞里可捕捉Lv.80超梦
暮水镇PC里大爆炸的学习点（暮水镇地图） 房子里得到TM27报恩
从暮水镇向右边沿最底层冲浪，带上古空棘鱼、巨鲸王和会挖洞技能的精灵（三神柱攻略） 顺着水流来到这个水域，潜水下去，阅读石板后上浮 对着石壁使用挖洞，出现一个洞口
进洞后以吼鲸王为头，古空棘鱼为尾读两遍石壁，出现门打开的提示 中间的洞里是圣柱王，现在还不能抓
飞到武斗镇向上冲浪，从左边的路口进入找到位于此处的遗迹 阅读石板后顺时针贴墙走一圈，出现洞口 洞内可捕捉Lv.40冰神柱 从紫堇市向上走找到沙漠的遗迹
阅读石板后左两步下两步使用碎岩打开洞口 洞内可捕捉Lv.40岩神柱
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水静市向左走，找到这里的最后一个遗迹 在中间使用闪光开启洞穴 进入可捕捉Lv.40钢神柱
暮水镇向左冲浪，回到开启机关的洞穴内，捕捉Lv.70圣柱王
在绿岭市的宇宙中心二楼，与研究员对话得到诞生岛船票（绿岭市地图） 去水静市码头坐船到达诞生之岛（水静市地图）
沿最短路线推三角，直到再次推到中间即可捕捉Lv.50迪奥西奇斯（迪奥西奇斯捕捉详细攻略） 在古辰镇右边的梦之实验室，在最里面的床上进入世界狭缝，选择左边的绿色大门 进入反转世界，银河团和等离子团正式登场 剧情结束后主角出现在梦源镇床上，小遥也在这里 再次点床可以回到世界狭缝
向下走来到红莲之窟，在洞内被抢走了两根羽毛，之后进入战斗（红莲之窟地图） 暗之忍精灵：Lv.64黑鲁加 Lv.64鬼盆栽 Lv.66阿勃索鲁
沿着路走，银河团抢走了月食之羽，洞口遇到银河团干部，进入战斗 银河团干部精灵：Lv.64青铜钟 Lv.64电击魔兽 Lv.64梅卡阳玛 Lv.66猫老大 胜利后出洞到达沙蜃镇，商店里可买到火焰石（沙蜃镇及道馆地图） 镇上有道馆，在门口遇到了梦世界的小光 梦世界第一个道馆为地面系
馆主精灵：Lv.64重甲暴龙 Lv.64鲶鱼王 Lv.64钢钻鼹鼠 Lv.65天蝎王 胜利后得到TM56压路
出镇向上走，在试炼之山桥边遇到盔甲人 捡到TM47钢翼
向上到达森隐镇，商店里出售黑淤泥等（森隐镇地图）
梦世界第二个道馆为毒系，有红色交叉花纹的砖是可以过去的，附线路图 馆主精灵：Lv.67毒刺水母 Lv.67尼多王 Lv.67尼多后 Lv.68叉字蝠 胜利后得到TM36毒爆弹
继续向上走，在迷茫小径遇到N，进入战斗
N精灵：Lv.70宝石海星 Lv.70猛犸猪 Lv.70风速狗 Lv.70巨钳螳螂 Lv.70狡猾天狗
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对话后继续向上，到达寄雨镇（寄雨镇地图） 道观门口的女子拜托主角找回图图犬
寂雨镇商店出售气息腰带等道具（魅影5.0里气息腰带为消耗性道具） 向上走来到魅影之森，在深处发现银河团的人（魅影之森地图） 银河团用月食之羽控制了希罗娜和库鲁玛的精灵，主角挺身而出
银河团干部精灵：Lv.72铁盘坚果 Lv.72叉字蝠 Lv.72巨蔓藤 Lv.73饭匙蛇 胜利后与希罗娜二人对话，得知这个世界的图鉴拥有者们也被冻结了
事件解决，回到寂雨镇得知图图犬已经回来了，并得到神奇糖果（寂雨镇地图） 可以去挑战道馆了，鬼系，需要踩蓝色地板传送
只有一条路线没什么可说的，这里被堵住路口只需要返回重新走一次即可 传送到这里，还是踩来时的地板即可到达馆主面前
馆主精灵：Lv.71海月水母 Lv.71鬼盆栽 Lv.71噬魂吊灯 Lv.72耿鬼 胜利后得到TM30影子球
回到魅影之森剧情点，从这里跳下去向右（魅影之森地图） 走出森林到达虹影市，商店出售叶之石等（虹影市地图） 挑战道馆去吧，草系
馆主精灵：Lv.74蜥蜴王 Lv.74叶精灵 Lv.74斗笠菇 Lv.75优雅仙子 胜利后得到TM09种子机枪
向右走在桥上遇到小光和暗之三位一体，进入战斗
暗之忍精灵：Lv.77狡猾天狗 Lv.77铁面忍者 Lv.78巨钳螳螂
阿戴克出现，对话后二人分道扬镳，继续向右走去映海市（映海市及通道地图） 映海市的商店出售水之石等
映海市道馆，虫系，与武斗镇道馆相似
馆主精灵：Lv.77大针蜂 Lv.77巨钳螳螂 Lv.77梅卡阳玛 Lv.78赫拉克罗斯 胜利后得到TM52蜻蜓返
向下冲浪，然后向右走，来到永冻之窟（永冻之窟地图） 走出洞窟，冲浪向下到达寒瀑镇（寒瀑镇地图） 寒瀑镇商店
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