如何用MS建模 - 图文

如何用MS建模

陶小马

在第一原理计算中有个POSCAR文件，那里面有晶体结构的一些信息，主要包括基矢以及原子的位子，那么一般来说简单的BCC、FCC、HCP以及Diamond结构都比较简单，可以直接输入就可以了，但是一般涉及比较复杂的结构如D019、D022等结构则可以用MS modeling来建模。在建立模型之前，我们要找到该化合物的结构方面的信息，这个主要可以通过Pearson手册来找寻，也可以用ICSD软件找。在有了结构方面的信息后，我们就可以利用MS Modeling来进行建模。

首先打开MS Modeling 软件： 建立一个新的文件名example

点击 File 出来一个菜单，点击New …后出现以下画面

双击第一个3D Atomistic,出现以下界面

这时你可以把鼠标指在3D Atomistic上 点击右键进行重新命名。后缀名为.xsd就可以了。

下边就点击Build—>Crystals—>Build Crystal…出现以下界面

在Enter Group： 中输入晶体结构的空间群的数字；点击Lattice Parameters中输入晶格常数后点击下面的Build：

例如我们要建立AlFe3的结构，它的结构信息如下：

也就是在Enter Group中输入225，在Lattice Parameters中输入5.789 A就可以了，点击Build得到以下界面：

现在就是加原子了，点击Build，下拉框中有Add Atoms，另外界面上也有就是一个原子左上角有个+号的就是。点击Add Atoms，可以看见以下的界面

在Element 中输入原子符号，右边的a，b，c就对应于上面我们找到的晶体结构信息中的x，y，z。也即，在Element中输入Al时，a，b，c中输入0 0 0，点击Add，再在Element中输入Fe，在a，b，c中输入0.5 0.5 0.5点击Add，还是Element为Fe，a，b，c中输入0.25