REALTIME PCR 步骤
主要试剂
1. Trizol Invitrogen公司 2. 焦碳酸乙二酯(DEPC)水 碧云天生物技术有限公司 3. 三氯甲烷 4. 异丙醇 5. 无水乙醇
6. PCR试剂盒 Takara公司
实验方法
一. 子宫内膜组织总RNA提取
1. 组织破碎:将适量子宫内膜组织移入研磨器,每50-100mg组织中加入Trizol溶液1ml,彻底匀浆,使内膜组织完全裂解。
2. 均一化:将RNA裂解液由研磨器转移至离心管中,管盖密闭后,在涡旋震荡器上剧烈震荡1 min,室温放置5-10 min。
3. 分离:每毫升Ttrzol中加入氯仿200 μl,管盖密闭后,充分振摇30s,室温放置5-15 min。
4. 低温高速离心机4℃,12000转,离心15 min(注意:离心不超过12000转),离心结束后液体分可为三层。
5. 将含RNA的上层无色水相(约占液体总体积的50%-60%)加入新的1.5 ml离心管中。
6. 按每毫升Trizol加异丙醇0.5 ml 的比例加入异丙醇,管盖密闭后,上下颠倒混匀。
7. 在室温下放置5-10 min,使RNA充分沉淀。 8. 12000转低温(4℃)离心10 min。
9. 弃上清,按每毫升Trizol加入75%乙醇1 ml的比例洗涤RNA沉淀。 10. 7500转低温离心5 min,弃上清。 11. 重复洗涤RNA沉淀一次。
12. 室温适当干燥,除去残余乙醇(注意:RNA不可过于干燥,难于溶解)。 13. 用20-40 μl去RNA酶水溶解RNA沉淀。
二. 核酸蛋白分析仪测定各样本RNA的含量及纯度 1. 分别测定260 nm,280 nm处的吸光值(OD)。 2. 记录RNA的浓度读数。
3. RNA纯度的判定:RNA的纯度根据A260nm/A280nm比值判定:比值大于1.9说明纯度较高,小于1.6说明含有蛋白,介于1.6-1.9之间说明含有不同程度的DNA 。
三. 逆转录生成cDNA (1)逆转录反应体系 5×PrimeScript Buffer 2 μl PrimeScript Rt Enzyme Mix I 0.5 μl Oligo dT Primer 0.5 μl Random 6 0.5 μl
Total RNA 1 μl (<500ng) RNase Free dH2O up to 10 μl (2)逆转录反应条件 37℃ 15 min 逆转录反应 85℃ 5 s 逆转录酶失活反应 四. 实时荧光定量检测 (1)PCR引物序列 (2)PCR扩增体系
SYBR Premix Ex TaqTM II (2×) 10 μl PCR Forward Primer (10 μM) 0.8 μl
PCR Reverse Primer (10 μM) 0.8 μl ROX Reference Dye (50×) 0.4 μl RT产物 2 μl ddH2O 6 μl 总体积 20 μl (3)PCR反应条件
PCR反应条件为95℃预变性30 s;然后95℃ 15 s、60℃ 60 s共40个循环,并检测溶解曲线。
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