注：
1、带“★”表示1小时以上的特别篇，带“◆”表示动画原创，即漫画原作中没有的，B表示出现黑衣组织，F表示出现FBI，C表示出现CIA，S表示出现工藤新一，X表示出现服部平次，K表示出现怪盗基德。
2、电视上播放的动画顺序与DVD版的收录顺序并不一致，该列表以电视播放顺序为[2]
准。
3、爱奇艺网将柯南国语版动画中的特别篇进行了拆分，因此其目录与日语版有差异。动画目录以日语版为准。
4、2011年8月～2012年8月间播出的《华丽的对手们》《红色之泪的秘密》等以基德（快斗）为主要人物的7集动画，改编自青山刚昌的另一部漫画作品《魔术快斗》，以柯南特别篇形式播出，可以算作《魔术快斗》动画版第2～8集，日本官方未将其算在《名侦探柯南》动画目录中
[2-3]
，但绝大部分视频网站都将其作为柯南正式动画而续接下去。（详
见“《魔术快斗》相关特辑”）
1996年（1－42）
1 云霄飞车杀人事件 B/S 2 董事长千金绑架事件 3 偶像密室杀人事件 4 大都会暗号地图事件 5 新干线大爆破事件
6 情人节杀人事件◆ 7 每月一件礼物威胁事件 8 美术馆杀人事件 9 天下第一夜祭杀人事件 10 足球选手恐吓事件
11 钢琴奏鸣曲《月光》杀人事件★ 12 步美被绑架事件 13 奇怪的寻亲杀人事件 14 谜样的讯息狙击事件◆ 15 消失的尸体杀人事件 16 古董收藏家杀人事件 17 百货公司挟持事件◆
18 六月新娘杀人事件 19 电梯杀人事件◆ 20 鬼屋杀人事件
21 电视台外景队杀人事件◆ 22 豪华客轮连续杀人事件（前篇） 23 豪华客轮连续杀人事件（后篇） 24 丧失记忆的美女事件◆ 25 真假人质绑票事件◆ 26 爱犬约翰杀人事件◆
27 小五郎同学会杀人事件（前篇） 28 小五郎同学会杀人事件（后篇） 29 计算机杀人事件◆
30 不在场证明杀人事件◆ 31 电视台杀人事件 32 咖啡厅杀人事件 33 侦探团生还事件◆
34 山庄绷带怪人杀人事件（前篇） 35 山庄绷带怪人杀人事件（后篇） 36 星期一晚上7:30杀人事件◆ 37 仙人掌花杀人事件◆ 38 赤鬼村火祭杀人事件
39 企业家千金杀人事件（前篇） 40 企业家千金杀人事件（后篇） 41 优胜锦旗被割事件◆
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