从以上结果可以发现存在信号肽序列部分,三维建模时需要去除掉该段序列,即去除信号肽序列(MLRRRGSPGMGVHVGAALGALWFCLTGA)得到的处理序列如下: >human_b7h3_4ig
LEVQVPEDPVVALVGTDATLCCSFSPEPGFSLAQLNLIWQLTDTKQLVHSFAEGQDQGSAYANRTALFPDLLAQGNASLRLQRVRVADEGSFTCFVSIRDFGSAAVSLQVAAPYSKPSMTLEPNKDLRPGDTVTITCSSYQGYPEAEVFWQDGQGVPLTGNVTTSQMANEQGLFDVHSILRVVLGANGTYSCLVRNPVLQQDAHSSVTITPQRSPTGAVEVQVPEDPVVALVGTDATLRCSFSPEPGFSLAQLNLIWQLTDTKQLVHSFTEGRDQGSAYANRTALFPDLLAQGNASLRLQRVRVADEGSFTCFVSIRDFGSAAVSLQVAAPYSKPSMTLEPNKDLRPGDTVTITCSSYRGYPEAEVFWQDGQGVPLTGNVTTSQMANEQGLFDVHSVLRVVLGANGTYSCLVRNPVLQQDAHGSVTITGQPMTFPPEALWVTVGLSVCLIALLVALAFVCWRKIKQSCEEENAGAEDQDGEGEGSKTALQPLKHSDSKEDDGQEIA
通过SOSUI预测膜蛋白和跨膜区
通过Predict Transmembrane Topology (MEMSAT3 &
MEMSAT-SVM)预测膜蛋白和跨膜区(good !)
http://bioinf4.cs.ucl.ac.uk:3000/psipred/result/55013
相关推荐: