WB-protocol
配液:
1mol/L Tris-HCl:12.114g Tris-base,加水至100ml,PH6.8 1.5mol/L Tris-HCl:18.7g Tris-base,加水至100ml,PH8.8 10%SDS: 5g电泳级SDS加水定容至50ml,可加热至68℃助溶 Acrylamide 29g
30%丙烯酰胺 methylene diacrylamide 1 g
加水至100ml溶解,避光4℃保存
{ 将29g丙烯酰胺和1g N,N’-亚甲双丙烯酰胺溶于总体积为60ml的水中。加热至37℃溶解之,补加水至终体积为100ml。用Pall滤器(0.45μm孔径)过滤除菌,查证该溶液的pH值应不大于7.0,置棕色瓶中保存于室温。}
10% AP:Ammonium persulfate10%(w/v)-20℃保存一个星期,一般一次配1ml。 Glycine 144g 10×running buffer (1L) Tris-base 30g SDS 10g
加水至1L 1×running buffer (1L): 直接从10×running buffer加水稀释 Glycine 145g 10× transfer buffer (1L) Tris-base 29g 加水至 1L
10×transfer buffer 100ml 1×transfer buffer (1L) methanol 200ml 加水至1L Tris-base 24.2g 10×TBS (1L) Nacl 80g 36%Hcl 约14ml pH调至7.6,加水至1L 10×TBS 100ml
1×TBST (1L) Tween-20 0.5ml(即0.05%,临用时加入)
加水至1L
封闭液(5%):也为抗体稀释液,5g脱脂奶粉溶于100ml 1×TBST配制
Glycerine 2ml(20%)
20×loading buffer(变性剂) bromophenol blue 0.03%(适量) DTT 0.3ml(3%)
4×upper tris 7.7ml 4×upper tris:Tris-base 12.12g(0.5M)、10%SDS 8ml,PH6.8,总计200ml
1×sample buffer:50mmol/L Tris-HCl(PH6.8),20g/L SDS(电泳级),10%Glycerol
Ponceau S 丽春红: 0.1%, 0.1g溶于5ml冰醋酸;H2O 至100ml,4℃保存。(可重复使用) DTT
组份浓度: 1 M DTT 配制量:10mL 配制方法:
1. 称取1.545g DTT,加入到15mL塑料离心管内。
2. 加10mL的0.01 M 的NaOAc(醋酸钠)(pH5.2),溶解后使用0.22μm滤器过滤除菌。 3. 适量分成小份后,-20℃保存。 3 M 醋酸钠(NaOAc)(100 ml)
1.称取40.8 g NaOAc•3H2O置于100~200ml烧杯中,加入约40ml的去离子水后搅拌溶解。
2.加冰醋酸调节pH值至5.2。
3.定容至100 ml,高压灭菌后室温保存。 (参照《分子克隆》二版P884)
0.01 M NaOAc (pH5.2) 参照此配方配制。
实验步骤
一、蛋白样品制备
1、 培养细胞的蛋白质样品的制备(还没做过组织的,以后补充)
a、收集:细胞培养至皿(100cm)上长满时,经PBS漂洗3次,加入1ml的1×sample buffer,细胞刮收集,冰上操作,转移至离心管中,置-20℃保存。
b、裂解:超声(超声5s间歇10s,功率100至120w)或注射器反复抽吸破碎,至细胞裂解液澄清不粘稠为止。置于冷冻离心机4℃25000g离心15min取上清; 2、 BCA(标准曲线)蛋白定量: a. 准备蛋白标准品 Vial A B C D E F G H I 标准品的稀释(20–2,000 μg/ml) H2O体积(ul) BSA体积(ul) 0 100 μl of Stock 50 150 μl of Stock 100 100 μl of Stock 50 50 μl of vial B dilution 100 100 μl of vial C dilution 100 100 μl of vial E dilution 100 100 μl of vial F dilution 100 25 μl of vial G dilution 100 0 BSA浓度 2,000 μg/ml 1,500 μg/ml 1,000 μg/ml 750 μg/ml 500 μg/ml 250 μg/ml 125 μg/ml 25 μg/ml 0 μg/ml b. 准备工作液 Working Reagent(A:B=50:1 )
所需体积=(# standards + # unknowns) × (# replicates) × (volume of WR per sample) c.操作步骤:
1.吸取25ul标准品及待测样品到96孔板(复孔1个),sample/WR=1:8(如果样品量太少多,改为上10ul sample/WR=1:20,检测范
围125-2,000 μg/ml)
2.加200ul的WR,摇床混匀1min;
3.合上盖子在37℃孵育30min; 4.冷却至室温,约20-30min
5.在紫外分光光度计562nm下读数 6.画标准曲线,算出待测样品浓度
3、 蛋白变性:在提取的蛋白中按每100ul加5ul 20×loading buffer混匀后,置98℃水浴锅中煮沸10min使蛋白变性。若离心5min可以避免拖尾现象。
二、制胶
1、 分离胶:一般来说,蛋白分子量越小 需要胶的浓度越大,SDS-PAGE分离胶浓度最佳分离范围(6%胶 50-150Kd;8%胶 30-90kD;10%胶 20-80kD;12%胶 12-60kD;15%胶 10-40kD)
按比例配制分离胶,轻缓摇动溶液8~9次,使激活剂混合均匀,配好后灌胶,然后用超纯水封胶。当水和胶之间有一条折射线时(约30min),就可倒去胶上层水并用吸水纸将水吸干。 2、 浓缩胶:沿玻璃板平缓注入凝胶溶液,然后保持水平插梳(上样孔不得留有气泡),静置30min后保证完全聚合。 3、 上样,依次加入蛋白marker和待分析样品,加样时间尽量短,避免样品扩散和边缘效应,可在未加样的孔中加入等量样品缓冲液。
三、 电泳
加样完毕,盖好电泳槽盖子并选择适当恒压,一般浓缩胶80V,20min,分离胶120V,90min,电泳至溴酚蓝跑出凝胶末端处即可停止。(通电时,检查有否气泡产生) 四、电转
电泳结束后,取出凝胶,在预冷电转甘氨酸缓冲液中漂洗数秒; 1、膜的预处理:
按胶的大小剪下相应大小的PVDF膜(在右上角剪一个缺角,作为转膜时正面的标记,下方标注蛋白名称、日期);将PVDF膜于甲醇中浸泡3-5min,放置于转膜液中; 2、按胶的大小剪切转膜用滤纸,共6张,置于转膜液中浸湿5min; 3、将浸透转移液的海绵、滤纸、PVDF膜和胶按下列顺序从下至上放置于湿转膜器中。从下至上为:夹子透明边-海绵-三层滤纸-PVDF膜-胶-三层滤纸-海绵-夹子黑色边。用玻璃棒轻轻碾压,挤出可能存在的气泡;放入转膜器(注意方向,PVDF膜对正极,胶对负极);
4、加入4℃预冷 Transfer buffer,80mA恒流转膜(低温),分子量50KDa左右的蛋白用120min,20KDa左右的用90min。一般转膜电流200mA之间,时间30~60min或15~20mA过夜。大片段(>50KD)可选350mA,小片段可选250mA。滤纸最好不要比膜大,防止短路,各层之间无气泡。槽内夹子两旁放入冰袋。
五、膜的封闭
进行抗体杂交前需对转印膜进行封闭,防止免疫试剂的非特异性吸附,取1×TBS漂洗3次×5min的转印膜,放入5%脱脂奶粉的封闭液内,摇床震动,室温封闭1h。
六、抗体杂交
封闭后的杂交膜放入杂交袋中,加入抗体稀释液稀释的一抗,去除袋内所有气泡,封口,4℃孵育过夜或室温(22~25℃)摇动孵
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