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648中国预防兽医学报2009年
为烬灰类群。2.2
生理生化指标
参照文献[6,7]中规定的相关
测定项目,对供试的5株菌进行了10种共38项生理生化特征鉴定,结果见表2。
表2供试菌的生理生化特性
Table2Physiologicalandbiochemical
characteristicsoftestedstrains
指标ActinomyceteIndex120202-F-1766J03
明胶液化Gelatinhydrolysis+++++-淀粉水解Starchhydrolysis-2.6-硝酸盐还原Nitricacidreduction+++卵磷脂酶Lecithinhydrolysi---硫化氢产生ProducingH2S++-+黑色素产生Tyrosinedrolysis++纤维素分解Utilizationofcellulose---+-+产酸Acidproduction
---石蕊牛奶试验产碱Alkaliproduction
+--Litmusmilktest胨化Peptonizatio
---凝固Coagulatio
---还原Reduction
+++尿素Urea
+++硝酸钾KNO3
---亚硝酸钠NaNO2
+++酪氨酸Tyrosine
+++丝氨酸Serine
++唯一N利用烟酰胺Nicotinamide+++Nitrogensource.甘氨酸Glycine++++甲硫氨酸Methionine
+++丙氨酸Alanine
+++谷氨酸Glutamate
+++腺嘌呤Adenine
+++阳对照PositiveCK
+++阴对照NegativeCK
+++D-葡萄糖Glucose
+++D-木糖Xylose
+++L-鼠李糖Rhamnose
+++D-果糖Fructose
+++蔗糖Sucrose
+++乳糖Lactose
+麦芽糖Maltose+++唯一C源利用甘露糖Mannose++
Carbonsource甘油Glycerol---+++山梨醇Sorbitol
++-醋酸钠Sodiumacetate
++-柠檬酸钠Sodiumcitrate
---草酸钠Sodiumoxalate
-++马尿酸钠Hippurate
++丁二酸钠Sodiumsuccinate++++阳对照PositiveCK
+++阴对照NegativeCK
strains
35013010++++++++2.12.7+++--+-+--+---------++++--++++++++-+++++++++-+++++++++++++++++--++++++--++++++++
toN2;Milkpeptonization:+peptonized<1/3,++peptonized1/3-2/3,
+++peptonized>2/3;CarbonandNitrogensource:+canbeusedorgrow,-cannotbeusedorgrow
表2结果显示,供试菌株的生理生化特征差异不大,尤其是硝酸盐还原、碳氮源利用能力等,若要进一步确定其分类地位,需借助分子手段。2.3
细胞壁化学组分分析
5株菌的细胞壁均含LL-DAP和甘氨酸,属胞壁Ⅰ型。全细胞水解液均含葡萄糖和核糖,但无特征性糖,糖型C。细胞壁类型和糖型均表现为典型的链霉菌特征(表3)。
Table3
菌株号StrainNo.120202-F-1766J0335013010
表3细胞壁化学组分分析
Analysisofchemicalcompositionofcellwall
全糖种类氨基酸种类胞壁类型糖型KindsofKindsofTypesofTypessugarAminoAcidCellwallofsugarGlu、Rib、ManGly、Asp、Glu、AlaCⅠ
Glu、RibCGly、Asp、Glu、AlaⅠ
Glu、Rib、ManCGly、Asp、Glu、AlaⅠ
Glu、Rib、ManCGly、Asp、Glu、AlaⅠ
Glu、RibCGly、Asp、Glu、AlaⅠ
DAP类型
TypesofDAPLL-DAPLL-DAPLL-DAPLL-DAPLL-DAP
注:Gly甘氨酸;Asp天门冬酰氨;Glu谷氨酸;Ala丙氨酸;Glu葡萄糖;Rib:核糖;Man甘露糖
2.416SrDNA序列分析将供试菌株的16SrDNA
序列与GenBank和EMBL数据库中链霉菌属相关的菌株进行16SrDNA序列比较,并以Nocardiopsis
aegyptica为外群,构建系统发育树(图1)。
注:明胶液化:-为不液化,+为液化<1/3,++为液化1/3~1/2,+++为液化1/2~2/3,++++为液化>2/3;硝酸盐还原:-为不还源,+为还原成NO2,++为还原成N2;牛奶胨化:+为胨化<1/3,++为胨化在1/3~2/3,+++为胨化>2/3;碳氮源利用:+能够利用或生长,-不能够利用或生长
Note:Gelatinliquefaction:-non-liquefaction,+liquefied<1/3,++liquefied1/3-1/2,+++liquefied1/2-2/3,++++:liquefied>2/3;Nitratereduction:-non-reduction,+bereductedtoNO2,++bereducted
在系统发育树上,菌株1202与Streptomyces
xantholiticus,Streptomycesgobitricini,Streptomycesnatalensis4株菌构成1个分支,1202与这3株菌的
序列同源性分别为95.45%,99.29%,95.15%,其中与Streptomycesgobitricini序列同源性最高。02-F-17与Streptomycesbikiniensis,Streptomycescaviscabies,
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