蛋白质组学答案终稿(14)

②烷基化反应高度特异。

③只分离含有半胱氨酸的肽段，降低了体系的复杂性。

④因为分离是在肽段水平上进行的，所以膜蛋白溶解性的问题得到解决，可以对膜蛋白进行鉴定和定量。

⑤因为同位素标记亲和标签技术建立在色谱分离的基础上，任何促进蛋白质溶解的试剂均可使用。 ⑥能够直接鉴定和测量低丰度蛋白质。

（2）缺点

①这一方法无法分析不含半胱氨酸的蛋白质；

②同位素标记亲和标签标记（-500u）在整个质谱分析过程中保留在每个肽上，会影响肽段的检测和增加数据库搜索算法的复杂性，对一些小的片段（小于7个氨基酸残基）更是如此，而对其二级质谱碎片离子解析增加了难度；

③被标记的2个多肽质量相差8u、含有2个半胱氨酸的多肽质量相差16u时与氧化很难区分，对定量和鉴定都带来困难；

④一般同位素标记亲和标签定量的误差在20%以内，但如果样品成分复杂，定量误差会增大，并往往需要手工检测结果；

⑤这种方法要获得完整的信息，最重要的是标记必须是特异、完全的，但当前标记的效率是时间依赖性的，很少能达到80%以上。

另外商品化试剂价位高，影响了应用。

由Gygi等首先发明了同位素标记亲和标签技术（isotope-coded affinity tag, ICAT）， 此技

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