生物信息学数据库_日本DDBJ数据库及其检索应用(1)(2)

情报检索

JournalofInformationNo.5,2003

Getentry(图1)在对DDBJ数据库进行检索时,输入的号码除了登录号以外还可以用Locusname、Genename、Productname、P_ID、Clonenumber和Patent号。通过专利号检索时,必须删去中间的空格,可省略其中的非字母数字式符号,如 _ 、 、 : 和 / ,举例如下:

JP1234567890-A1 JP1234567890-A1或JP1234567890A1(专利号) 或JP1234567890-A/1 (检索输入格式)

采用kinase[keywords]andhuman[organism]的组合方式来进行检索,结果共检得78

条相关记录。

检索结果可直接在页面得到显示,也可通过E-mail的形式获得,如图1所示。检索结果与其它数据库的兼容性好,可与Normal、FASTA、EMBL、Transl、CDS、Qvalue、XML

等数据库兼容。

图3 Standard检索界面

扩展检索允许用户通过定义多个字段来确定检索策略,这样能使检索结果更加精确,但是过多的修饰会造成检索结果过少甚至没有符合要求的结果。这种检索方式比较适合掌握较多的有关方面的资料或者通过前两种方法的检索发现检索结果过多的情况。

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