分子生物学
结构分子生物学部分
绪论
①总述:进化论、细胞学说、生化遗传学、DNA的发现 ②分子生物学:定义、研究内容(四方面) ③发展史:里程碑
④三个相关学科:生物化学、细胞生物学、遗传学 ⑤中心法则:经典、现代
Ⅰ DNA ①结构:碱基比率、配对规则、种数(4n)、0.34nm的应用(碱基对M/2x,长度0.34×M/2x) ⑴三类DNA(ABZ):结构、形成、特点及Z-DNA的作用
⑵质粒超螺旋:正负超螺旋定义、转化、意义、计算、主要以负超螺旋存在
3-⑶其它:0.34nm的计算、※DNA稳定因素(PO4)与Tm、Z-DNA不稳 ②性质
⑴复性:五条件、机制(Cot曲线)、三个吸光度 ⑵修饰:甲基化(ACG)
O
⑶变性:DNA碱性全变性、90C以上全变性增色37%、增色效应(Tm) ⑷水解:酸(PH<1,=4,甲基化DNA酸水解用处);碱(RNA PH:13,11,DNA去碱基易) 酶(内切、外切)
⑸DNA稳定因素:对应核苷酸的P同电相斥、Na+、Tm ⑹分子伴侣:作用、分类(热休克蛋白、伴侣素)、作用机理(四条)
Ⅱ tRNA
①形成:转录成三类,3‘去尾,5’斩头,化学修饰成稀有碱基(I、ψ) ②二级结构:四个臂(受体臂、反密码子臂、D臂、TψC臂),多余臂(2类),
tRNA长度决定因素(D臂、多余臂)
③三级结构:特点、二三级氢键、两个双螺旋、转折处()、两端点()
受体臂与反密码子臂距离远及原因
④功能:转运氨基酸(受体臂3‘-CCA)、解读密码子(反密码子臂)
⑤种类:tRNAi/tRNAe(起始/延伸),同工tRNA(定义)tRNA性质由反密码子决定
Ⅲ 核糖体
①核糖体的细胞学知识:见细胞生物学 ②三个位点:A、P、E作用
③原核30S小亚基上16SrRNA反SD序列:结构(3ˊ富含嘧啶区GAUCACCUCCUUA)、作用
Ⅳ mRNA
①真原核比较:帽、尾、单多顺反子、起始密码子个数原核有三个起始密码子
(AUG>GUG>UUG)、T1/2、原核特有SD序列
②真核mRNA三类帽:0、1、2类定义
③原核mRNA的SD序列:5‘,作用,结构
Ⅴ蛋白质与核酶 ①结构域:
②分子伴侣:分类、作用机制
③核酶:定义、分类(剪接、剪切)剪切分三类:锤头、发夹、丁肝病毒核酶
基因组学部分
Ⅰ 染色体
① 观察:有丝分裂中期光学显微镜可见 ② 功能:遗传载体
③ 作为遗传物质所需四要素:稳定、半保留复制、产生蛋白质、可变异
Ⅱ 真核基因组
①组成:DNA(或RNA)+Protain(组、非组)
②DNA:C值与C值反常现象、三序列(不重复、中度重复、高度重复)占序列比例,单
/多拷贝
③组蛋白:六种、特征(保守、特例、氨基酸不对称、修饰、H5-赖氨酸) ④非组蛋白:三种常见,DNA结合蛋白的定义 ⑤真核基因组结构基础--核小体 ⑴组成:200bpDNA+八聚体
⑵八聚体:2×(H2A+H2B+H3+H4) ⑶结构:
颗粒(八聚体+120bpDNA链,直径10nm,DNA链绕1.65圈) 连接DNA(80bpDNA链+H1,H1作用) 是负超螺旋
⑥染色单体:螺线管、螺旋n倍 ⑦端粒与端粒酶
⑴端粒:真核基因组末端,功能(防真核基因组末端结合)
⑵端粒酶:反转录酶、功能(反转录成端粒、连接后随链所得的冈崎片段)、
反转录机理(
Ⅲ 原核基因组
①真原核基因组比较: 大小(真核大,原核小)
复杂度(断裂/连续、大多为调控/表达区、重复序列/重叠基因) 复制(真核多向,原核单向) 转录(单顺反子/多顺反子) 真核特殊(DNA多态性、端粒)
②真原核基因表达的比较:复制、表达连续性及机理
Ⅳ 真核基因组结构
①hnRNA内含子:GU-AG法则,3‘嘧啶区,5‘保守区、3’上游18-50处的保守区 ②启动子:核心(TATA,决定转录起始位点)、识别RNA聚合酶(CG、CAAT,决定转录
起始频率)
③增强子:定义、结构、作用机制、特点、代表(β-珠蛋白基因) ④终止子:两类(依赖/不依赖ρ因子)、结构特点、作用机理、穷追模型
Ⅴ 原核基因组结构
①启动子:-35区(识别RNA聚合酶),-10区(结合RNA聚合酶)
Ⅵ 基因组学
①几个定义:重叠基因、断裂基因、基因家族、基因簇、超基因家族、假基因、管家基
因、奢侈基因、组织特异性基因
②顺式与反式作用因子:
⑴顺式作用元件:定义,启动子、增强子、沉默子 ⑵反式作用元件:定义,转录复合物 ③人类基因组计划: ④比较基因组学:
基因表达部分
ⅠDNA复制
①半保留复制:定义、意义、发现(N14N15)
②半不连续复制:前导链、后随链、冈崎片段、过程、实验证明(电泳、30s) ③复制起点:复制叉、复制子、复制起点特征
④复制方式:线性-眼形,环状-3种(θ型、滚环型、D环型;各对应DNA种类、机制) ⑤复制方向、速度:三种,以定点反向等速为主 ⑥复制所需酶、蛋白:拓扑异构酶(两类)、解旋酶、SSB(作用);引发酶;DNA聚合酶
(见下)、DNA连接酶
※ DNA聚合酶:
原核:Ⅰ→Ⅴ结构与功能(聚合酶活性、外切酶活性),Ⅲ最主要 真核:αβγωδ,αδ最主要
功能总结:与连接酶共同作用(合成子链、损伤修复校正、补冈崎片段的连接处) ⑦原核DNA复制过程及酶的作用:DNA解旋(三种酶)→引发(引物的作用)→延伸→终止
⑧复制特点:子链复制方向:5’→3‘,原核、真核连续性 ⑨复制的调控:
⑴原核:复制叉多少决定起始频率,起始频率直接调控因子—RNP ⑵真核:三个水平(细胞周期、染色体、复制子)
Ⅱ DNA损伤与修复
①损伤:三种(紫外线、脱氨、甲基化、氧化机制,对应修复法):碱基异常(U-G、T-G) ②变异:基因突变基础、突变类型、突变后果 ③修复:切除(碱基、核苷酸),错配(Dam、5‘GATC3’),重组(先复制后修复),
直接(光修复、去甲基化),SOS();各修复机理(所需酶)
Ⅲ DNA转录与逆转录
①转录的定义:转录、转录单元 ②转录特点:不对称(正负链定义、负链为模板,多基因DNA正负链相间);连续单向(mRNA5
‘→3’);有起始终止位点(启动子、终止子定义);能力(双链强于单链及原 因);不需完全解链
③转录起始位点:定义、上下游表示法(-n/+n);原核启动子(-10区、-35区结构、
功能,两区最佳间距)、真核启动子(TATA区、CAAT区、GC区结构、功能);启动子的上升/下降突变
④ 转录所需酶、复合物:RNA聚合酶(见下);复合物(转录因子定义、分类、结构与
功
能) ※ RNA聚合酶:
真核:ⅠⅡⅢ(对应三种内含子),Ⅱ最主要,对应三种RNA(rRNA、hnRNA、tRNA),
对α-鹅膏蕈碱敏感度(三类) 原核:(α2ββˊ)σ:α2ββˊ为核心酶,ββˊ与原核启动子识别、结合,σ协助ββˊ
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