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一个控制水稻叶色白化转绿及多分蘖矮杆性状基因hw-1(t)的鉴定(8)

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作物学报,农作物,期刊,一级学报,写作

作物学报第38卷

Table5

与hw.1(0基因连锁的SSR和InDel标记

PCR basedSSRandInDelmarkerslinkedtohw-1(0

反向引物

Reverse

表5

gene

M池r

RMl7595RMl7605HW2HW21HWl5HW3HW27HW36HW7

RMlll3RM559

标记正向引物

ForwardPrimer(5L3。)

起始位点

Startposmon(bp)a

#增岁段

primer(5f_3’)

裟篙

171194255288169299189860289428169

GGGATCACGGAGCTCAAGTACCATTAAGGGCCTGCTCTGTTCTGCTGTCAGCCATCGTCATCGATCCAAGCCTCCCGTCTGCTCCACCATTCATTTCTACTGTCGCATGGTGAGATAGGAGCAACAGGCGTTAGTCTATGGTATGCTTTTCAGACGGTCGTCGTCCTCTTCTCTTCATCGGTTCTTGGGTTGGTGAGCTTCCAGAGCGATGGGTGTCAGTTTGC

GCTCCTCCCAAACCCAAATCCGTCCACTCCTCTCCCTATCATGCAGCCGTCAGTCAGCAAAGGTCAGGGCTCTTCTGCACTCTACTCCGAGATGCCGTCGTTAGGTGAAGGAGACGGGAAAGATTTCGTGGTCTCATAGGTTGAGACGAGAGTTATACTCCT

GCTAACACCGAAAGAGGCAAAGCTAGGGCGCATGTGTATTTCTTCCCGTACGTACACTTGGCCCTATGC

3346848133680591336925573377763433866129338798923390251933923819339495693408597335151595

4对应的粳稻品种日本晴第4染色体的基因组位置。

Thegenomicpositionof

chromosome4inricecultivarNipponbare

RM348

RMl7595

RMl7605

RMl113

RM559

Chr.4N=126

Marker

BMarker

RMl7605HW2HW21HWl5HW3HW27HW36HW7

RMlll3

Geneticdistance

1.4881.1160.7970.6380.2390.186:0.053eM0.292

(c№

BAC

56

4230

24

97

02

11

N=1882

Physicaldistance

Ge∞似呻

10

11

12

13

Fig.7

利用F2作图群体(hfa.1x02428)定位hw.J㈣基因

Mappingofthehw 1(0geneusingtheF2population(hfa-lx02428)

图7

(A)hw一1(0被初步定位在第4染色体SSR标记RMl7605和RMlll3区间内;(B)hw.1(0被精细定位在第4染色体InDel标记HW27和

HW7区间内;(c)通过GRAMENE数据库预测46.9kb区间内有13个候选基因(表6)。

(A)hw一1(0wasmappedtotheintervalbetweenSSRmarkersRMl7605andRMlll3inchromosome4;(B)hw一1(0wasfinemappedto

intervalbetweenInDelmarkersHW27andHW7inchromosome4;(C)Inthe46.9kbregion,13putativegeneswereannotatedin

GRAMENEdatabase(Table61.

the

片斑驳,即同一片叶出现白化和绿色表型。现已探明与拟南芥IM突变体存在诸多相似,推测LOC—Os04957320最有可能为J}1w.J例的候选基因。

拟南芥眺突变体的斑驳表型由单隐I生基因控制,且受

光强和温度调节‘581。拟南芥砌基因突变除了影响叶片表型外,还对植株的其他性状产生广泛的影响,例如植株变矮,根部延迟生长。考虑到hfa—J的突变表型

3讨论

叶绿素合成通路或叶绿体蛋白转移途径上的任

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