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猪戊型肝炎(21)

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研究生论文

图1-2 HEV基因组结构图

A:缅甸株基因组结构图 B:T1株基因组结构图

ORF1:MT= 甲基转移酶 Pro=木瓜蛋白酶样半胱氨酸蛋白酶 Helicase=RNA解旋酶 Replicase=RNA依赖的RNA聚合酶

ORF2

ORF3:?:功能不明

1.3.2.2编码蛋白

HEV基因Ⅰ~Ⅲ型和基因Ⅳ型的3个ORF编码产物大小不同,基因Ⅳ型ORF1、ORF2和ORF3编码的蛋白质长度分别是1707aa、 672aa和123aa,而基因Ⅰ~Ⅲ型分别是1693aa、 660aa和112aa 。基因Ⅳ型ORF2和ORF3多肽氨基端明显不同,但通过计算机分析显示,改变后的ORF2和ORF3仍有完整的信号肽,说明虽然基因结构发生了改变,但仍能保证其正常的功能。

(1) ORF1编码蛋白(p ORF1)

ORF1主要编码与病毒RNA复制有关的非结构蛋白(Khoonin EV, 1992 )。p ORF1氨基酸序列所含的多种功能性结构域从N端到C端分别为病毒甲基转移酶;功能未知的Y结构域,木瓜蛋白酶样半胱氨酸蛋白酶,富含脯氨酸的“铰链”结构域,功能未知的X结构域,RNA解旋酶和RNA依赖的RNA聚合酶。

p ORF1中甲基转移酶结构域的存在提示HEV基因组RNA具有5’帽子结构,此已被证实(Lazizi Y et al.,1999;Zhang M et al., 2001)。重组HEV基因组的体内感染实验(Emerson SU et al.,2001)表明,HEV基因组的5’帽子结构是HEV保持活力和感染性所必须的。Magden 等也证(Magden J et al., 2001)。这为抗病毒实在昆虫细胞中表达的p ORF1其活性可被帽结构类似物抑制药物的研制提供了理想的靶向。

RNA依赖性RNA聚合酶可与基因组RNA 3’端特异性结合,从而指导互补链RNA的合成,基因组RNA3’端的两个茎环结构SL1和SL2以及poly(A)尾是特异结合所必须的(Agrawal S et al., 2001)。

ORF1第2011~2325nt为HEV相对高变区,编码为100aa,由于ORF1编码的蛋白不在病毒表面,并不需要不停的改变以逃避宿主免疫系统的压力,该高变区可能与HEV重要功能基因相对稳定,而不重要的基因区高度突变以适应病毒的生存和进化。

(2) ORF2编码蛋白(p ORF2)

ORF2为主要的结构基因编码区,p ORF2分子量约为75KD。对其氨基酸序列的分析显示其具有典型的病毒衣壳蛋白特征(Tam AW et al., 1991),即在N端起始密码子之后,由18个疏水性氨基酸(5~22)构成典型的信号肽序列和一个富含碱性氨基酸的衣壳样区域,并含有潜在的切割位点,这与HEV的颗粒形成有关。

Zafrullah等通过对HEV ORF2蛋白糖基化的分析,认为在哺乳动物细胞中表达的p ORF2首先被合成82 KD的前体,之后被切掉信号加工为74KD的p ORF2,最后进一步糖基化加工成88 KD的

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