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植物总RNA的提取及RT-PCR(2)

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生物学实验技术

摇匀,加入100 l三氯甲烷,摇匀。

(3) 12000 rpm 4℃离心20 min,吸取上清,加入等体积异丙醇,于冰上放置15 min。

(4) 12000 rpm 4℃离心10 min,将沉淀悬浮于含100 l 4M氯化锂的1.5 ml EP管

中,于-20℃放置1小时或更长时间。

(5) 12000 rpm 4℃离心10-15 min,将沉淀溶于0.4 ml DEPC水中,加入1/2体积

氯仿和1/2体积酸酚,摇匀,进行抽提,12000 rpm 4℃离心5 min;上清加入等体积氯仿,摇匀,进行抽提,12000 rpm 4℃离心5 min。

(6) 上清液加入1/10体积的3 M乙酸钠和两倍体积的无水乙醇于-20℃放置1小时或

更长时间。

(7) 12000 rpm 4℃离心15 min,超净台吹干,沉淀溶于10 l b灭菌的DEPC水中。

(8) RNA贮于-80℃。

(二)RNA反转录产生cDNA

在DEPC处理过的离心管中冰上按下表加入:

模板RNA

Olig(dT)18

DEPC 水 2 µl 1 µl 2 µl

混匀,70℃水浴中放置2 min,立即放置到冰上2 min。然后在冰上依次加入:

RNasin

M-MLV

5×buffer

10 mM dNTP 0.5 µl 1 µl 2 µl 1.5 µl

42℃,水浴中反应90 min。72℃,10 min,终止反应。

加入15 µl的DEPC灭菌水,使总体积达到25 µl。

(三) PCR

1. 在灭菌的PCR管中加入以下成分,形成PCR反应体系

10 X buffer 2.5 µl

dNTP (2.5 mmol) 2 µl

RT-PCR产物 5 µl

Taq酶 0.5 µl

上游引物(10 µmol/l) 0.5 µl

下游引物(10 µmol/l) 0.5 µl

灭菌ddH2O加到25 µl

2. 按照下列条件进行PCR反应

94℃ 5 min

94℃ 30 s

55℃ 30 s

72℃ 1 min

30个循环

72℃ 7 min

4℃

(四)电泳检测

将加EB的1 %变性琼脂糖凝胶放入水平电泳槽中,加1×TE电泳缓冲液,覆盖凝胶约1 mm。将RNA及DNA样品加到凝胶点样孔中, 85 V条件下电泳30 min,在紫

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